Los sarcomas son tumores raros que a menudo se diagnostican erróneamente. Los reordenamientos cromosómicos recurrentes específicos, conocidos como translocaciones, pueden servir como marcadores de diagnóstico esenciales y se encuentran en aproximadamente el 20 por ciento de los sarcomas. La identificación de estas translocaciones ayuda a establecer un diagnóstico correcto y guía el tratamiento.informar en el Revista de Diagnóstico Molecular describe un nuevo ensayo, secuenciación dirigida de próxima generación basada en PCR multiplex anclada AMP NGS, con una utilidad de diagnóstico superior en comparación con las técnicas convencionales. Esto incluye la capacidad de analizar numerosos genes diana simultáneamente e identificar nuevos socios de fusión.En cuatro casos, el ensayo diagnosticó sarcoma en muestras consideradas falsamente negativas por pruebas convencionales.
"Los sarcomas son cánceres raros de hueso, grasa o músculo que son difíciles de diagnosticar y a menudo se diagnostican erróneamente. Existen más de 50 subtipos. Hasta ahora, para cada subtipo de sarcoma y cada translocación, se tenía que realizar una única prueba de detecciónla presencia de una fusión de genes única y específica. Ahora, en contraste con los métodos convencionales, se pueden analizar 26 genes diferentes para determinar su participación en una translocación en un solo ensayo ", explicó Judith VMG Bovée, MD, PhD, del Departamento de Patología, Leiden University Medical Center, Leiden, Países Bajos.
Para validar la utilidad de esta nueva prueba, los investigadores analizaron 81 muestras usando la nueva técnica AMP, para NGS usando el Archer® FusionPlex® Sarcoma Kit. Luego compararon los resultados con los de métodos más convencionales, como la hibridación fluorescente in situFISH y PCR de transcriptasa inversa.
El objetivo de estas técnicas es identificar anormalidades genéticas específicas en las que las regiones del material genético se reorganizan translocan, lo que puede ayudar en el diagnóstico. "Tanto FISH como la transcripción inversa-PCR están acompañadas de desafíos en la aplicación de rutina. Debido a estolimitaciones, la necesidad de métodos novedosos para la detección de fusión ha crecido significativamente a medida que se revelan más y más translocaciones recurrentes con el avance de NGS ", señaló el coautor Suk Wai Lam, MD, del Departamento de Patología del Centro Médico de la Universidad de Leiden, Leiden, Los países bajos.
De las 81 muestras analizadas por la nueva técnica, 70 muestras fueron analizadas con éxito. Se encontraron fusiones en 48 de ellas, mientras que 22 fueron negativas a la fusión. En el 90 por ciento de los casos los resultados usando el nuevo ensayo coincidieron con los resultados deprueba convencional.
En cuatro casos, los métodos convencionales omitieron la translocación tres con FISH y uno con transcripción inversa-PCR. Este problema puede ocurrir con mayor frecuencia en el sarcoma de Ewing, en el que el cebador utilizado por transcripción inversa-PCR se centra en los más comunestipo de fusión y puede pasar por alto alternativas menos comunes. En otro caso de sarcoma de Ewing, la presencia de reordenamientos complejos fue más allá de las capacidades de FISH, mientras que NGS produjo resultados definitivos.
En el caso de dermatofibrosarcoma protuberans, los hallazgos más detallados proporcionados por el nuevo ensayo arrojaron información crucial que impactó el manejo del paciente. El ensayo confirmó la presencia de la rara translocación COL1A1-PDGFB, que abrió el camino para que el paciente recibiera terapia dirigidacon imatinib.
El nuevo ensayo también ofrece otras ventajas distintivas. Su alta sensibilidad le permite detectar la presencia de una translocación en muestras pequeñas, y puede usarse para el análisis de material fijado en formalina e incrustado en parafina, así como tejido fresco congeladoSin embargo, el estudio mostró una tasa de fracaso del 14 por ciento para los NGS dirigidos basados en AMP. "Ninguno de los ensayos moleculares utilizados en el presente estudio fue capaz de proporcionar un cien por ciento de certeza con respecto a resultados falsos positivos y falsos negativos", afirmó el Dr. Lam." Sin embargo, creemos que esta nueva prueba ayudará al patólogo a establecer el diagnóstico correcto en el complejo mundo de los sarcomas ".
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Materiales proporcionados por Elsevier . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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