Científicos belgas de VIB y UGent desarrollaron Virotrap, un enfoque de clasificación de partículas virales para purificar complejos de proteínas en condiciones nativas. Este método captura una proteína de cebo junto con sus asociados de proteína asociados en partículas similares a virus que se originan de células humanas., la lisis celular no es necesaria y los complejos de proteínas se conservan durante la purificación. El desarrollo y la aplicación de esta técnica pionera se describen en un artículo publicado en Comunicaciones de la naturaleza .
Con sus pies en un laboratorio de proteómica y un laboratorio de interactomía, el profesor de VIB / UGent, Sven Eyckerman, es muy consciente de las deficiencias de los enfoques convencionales para analizar complejos de proteínas. Las condiciones de lisis requeridas en las estrategias basadas en la espectrometría de masas para romper las membranas celulares abiertasa menudo afectan las interacciones proteína-proteína ". El primer paso en un estudio clásico sobre complejos de proteínas convierte esencialmente la estructura celular altamente organizada en una gran sopa desordenada", explica Eyckerman.
Inspirado por la biología del virus, Eyckerman ideó una solución creativa: "Utilizamos el proceso natural de formación de partículas de VIH para nuestro beneficio al piratear una forma completamente segura del virus para secuestrar las máquinas de proteínas intactas de la célula".se sabe que el virus del VIH captura una serie de proteínas del huésped durante su formación de partículas. Al fusionar una proteína de cebo con la proteína GAG del VIH-1, los compañeros de interacción quedan atrapados dentro de las partículas similares a virus que brotan de las células de mamíferos.para revelar el contenido de estas partículas. Apropiadamente, el equipo nombró el método 'Virotrap'.
El enfoque de Virotrap es excepcional ya que las redes de proteínas se pueden caracterizar en condiciones naturales. Al atrapar complejos de proteínas en el entorno protector de un caparazón similar a un virus, los complejos intactos se conservan durante el proceso de purificación. Los investigadores mostraron que el método era adecuado paradetección de interacciones binarias conocidas, así como identificación basada en espectrometría de masas de nuevos socios proteicos.
Virotrap es un ejemplo de libro de texto de reunir a equipos de investigación con experiencia complementaria. La polinización cruzada con los laboratorios de Jan Tavernier VIB / UGent y Kris Gevaert VIB / UGent permitió el desarrollo de esta plataforma.
Jan Tavernier: "Virotrap representa un nuevo concepto en el análisis co-complejo en el que la estabilidad compleja está garantizada físicamente por una estructura física protectora. Es complementaria al arsenal de métodos interactómicos existentes, pero también tiene potencial para otros campos, como las drogascaracterización del objetivo. También desarrollamos una pequeña molécula-variante de Virotrap que podría atrapar con éxito a las proteínas asociadas para los cebos de moléculas pequeñas ".
Kris Gevaert: "Virotrap también puede afectar nuestra comprensión de las vías de la enfermedad. De hecho, nos sorprendió ver que este sistema basado en virus podría usarse para estudiar vías antivirales, como la señalización del receptor tipo Toll. Comprender estas máquinas de proteínas en su forma naturalel entorno es esencial si queremos modular su actividad en patología "
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por VIB Flanders Institute for Biotechnology . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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