"¿Cuántos tipos de células diferentes hay en un cuerpo humano? ¿Y cómo se desarrollan estas diferencias? Nadie lo sabe realmente", dice el profesor Stein Aerts de KU Leuven Universidad de Lovaina y VIB, Bélgica. Pero gracias a un nuevo métododesarrollado por su equipo, que puede estar a punto de cambiar.
Aunque cada una de las células de nuestro cuerpo lleva exactamente la misma secuencia de ADN, existe una gran variedad de tipos y funciones celulares. Estas diferencias se derivan de cómo se interpreta la secuencia de ADN: no todos los genes están 'activados' en cada célula.
Los avances recientes en la secuenciación de células individuales ya han permitido medir cuáles de nuestros 20,000 genes están activos en una célula individual. Con más de 30 billones de células en el cuerpo humano, estas técnicas proporcionan un nivel de detalle sin precedentes que está revolucionando la investigaciónen biología y medicina. Pero cuando este método se aplica a miles de células de diferentes tejidos, se vuelve cada vez más difícil procesar las enormes cantidades de datos y detectar patrones significativos.
El biólogo computacional Stein Aerts KU Leuven y VIB y su equipo unieron fuerzas con matemáticos, bioingenieros y especialistas en TI para enfrentar el desafío ". Desarrollamos SCENIC, un programa informático que identifica diferentes tipos de células en función de sus patrones de expresión génica, de forma rápida y precisa. Esto permite una mejor comprensión de cómo se regula el destino de los tipos de células y la identificación de reguladores maestros, que también podrían ser objetivos potenciales de medicamentos ".
"Este método novedoso no solo nos ayuda a aprender más sobre las diferentes células de nuestro cuerpo", dice la investigadora postdoctoral Sara Aibar Santos. "También nos dice cómo cambia la actividad celular en el transcurso del tiempo, o cuando tenemosenfermo."
El equipo ya aplicó el método al tejido cerebral de ratones y humanos. También lo utilizó para analizar y comparar células cancerosas de tumores cerebrales y de la piel, lo que condujo a la identificación de nuevos tipos de células relacionadas con metástasis, la propagación del cáncercélulas a otras partes del cuerpo.
El método podría ayudar a desarrollar el Atlas de células humanas, un esfuerzo global destinado a mapear todos los diferentes tipos de células y estados en el cuerpo humano. "Este atlas sería una fuente invaluable de información para la investigación y la medicina", continúa Aibar Santos."Nos permitiría estudiar sistemáticamente los cambios biológicos asociados con diferentes enfermedades, comprender dónde están activos los genes asociados a enfermedades en nuestros cuerpos, analizar los mecanismos moleculares que gobiernan la producción y la actividad de diferentes tipos de células, y clasificar cómo las diferentes célulaslos tipos se combinan y trabajan juntos para formar tejidos "
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Materiales proporcionado por KU Lovaina . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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