Investigadores del Brigham and Women's Hospital han discernido que las diferentes funciones de los tejidos surgen de una maquinaria biológica central que se comparte en gran medida entre los tejidos, en lugar de sus propios reguladores individuales. En un artículo publicado en Informes de celda , Kimberly Glass, PhD, de la División Channing de Network Medicine, y su equipo explican cómo utilizaron PANDA Atributos de paso entre redes para la asimilación de datos para crear modelos de red de las interacciones entre los factores de transcripción y los genes, descubriendo queLa presencia de diferentes funciones tisulares es el resultado de cambios sutiles y específicos de tejido en una red reguladora. Para cada una de estas funciones específicas de tejido, la red tiene los mismos componentes centrales, pero se combinan de diferentes maneras con el agregado genético y ambientalEl equipo analizó los datos del consorcio Genotype-Tissue Expression GTEx, entre otras fuentes de información reguladoras, para reconstruir y caracterizar redes reguladoras para 38 tejidos.
PANDA, un modelo creado por Glass y su equipo en 2013, fue calificado de manera única para esta investigación porque puede modelar con mayor precisión las interacciones entre los factores de transcripción, que ayudan a controlar dónde, cuándo y en qué medida se activan los genes, y susobjetivos. Resumir las complejas interacciones entre los factores de transcripción y los genes es un paso importante para comprender los patrones en la red que informan cómo la regulación génica da lugar a una variedad de funciones específicas del tejido.
Los autores también observaron que la regulación de la función específica del tejido es en gran medida independiente de la expresión del factor de transcripción. Señalan que hay aproximadamente 30,000 genes en el genoma humano, pero menos de 2,000 de ellos codifican factores de transcripción.
"Se debe llevar a cabo una gran cantidad de procesos para que un tejido funcione correctamente", dijo Glass. "En lugar de activar factores de transcripción particulares para llevar a cabo estos diversos procesos, encontramos que las redes que conectan estos reguladores a sus genes objetivo"se reconfigura para coordinar de manera más efectiva la activación de esas funciones tisulares "
El equipo señala que su trabajo resalta la importancia de considerar el contexto de tejidos específicos cuando se desarrollan terapias con medicamentos. Dado que las redes reguladoras cambiadas gobiernan diferentes funciones, esto será importante para comprender los posibles efectos secundarios de los medicamentos fuera del objetivotejido.
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Materiales proporcionados por Hospital Brigham y de mujeres . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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