Solo una de cada cuatro personas diagnosticadas con leucemia mielógena aguda LMA sobrevive cinco años después del diagnóstico inicial. Para mejorar esa tasa de supervivencia, los investigadores de la Universidad de Texas en San Antonio UTSA y el MD Anderson Cancer de la Universidad de TexasEl Centro creó un atlas en línea para identificar y clasificar las firmas de proteínas presentes en el diagnóstico de AML.
Las nuevas clasificaciones de proteínas ayudarán a los investigadores y médicos a recomendar un mejor tratamiento y medicamentos personalizados para los pacientes que padecen este cáncer agresivo, que ocurre en la sangre y la médula ósea. La investigación innovadora se publica en la última edición de abril de Ingeniería biomédica de la naturaleza .
Investigadora Amina Qutub, profesora asociada en el Departamento de Ingeniería Biomédica de la UTSA que se unió a la UTSA en 2018 de la Universidad de Rice, y el oncólogo Steven M. Kornblau, profesor y clínico practicante en el Departamento de Leucemia del Centro de Cáncer MD Anderson de UT, examinó la diversidad genética, epigenética y ambiental que se produce en las células cancerosas debido a la LMA. Analizando las pantallas proteómicas de 205 biopsias de pacientes obtenidas en el MD Anderson Cancer Center, primer autor Chenyue Wendy Hu entonces un estudiante graduado en el Laboratorio Qutub, ahora en UberTecnologías, Kornblau y Qutub desarrollaron un nuevo método computacional llamado MetaGalaxy para clasificar las firmas de proteínas en 154 patrones diferentes en función de sus funciones y vías celulares.
Al abordar este desafío a través de la lente única de desarrollar un mapa cuantitativo para cada paciente de leucemia a partir de la expresión de proteínas en su sangre y médula ósea, en lugar de la lente estándar de métricas cualitativas y riesgos genéticos solos, Qutub, Kornblau y sus colaboradores de investigación lo haránser capaz de clasificar con mayor precisión a los pacientes en grupos de riesgo y predecir mejor los resultados de su tratamiento.
Para comprender mejor las características distintivas de AML a nivel proteómico sistema de proteínas y compartir los resultados de su trabajo con otros investigadores, la profesora de ingeniería biomédica de la UTSA y su equipo, incluido Hu, y los estudiantes Andrew Ligeralde ahora en la Universidad de California, Berkeley y Allie Raybon del Departamento de Ingeniería Biomédica de la UTSA construyeron un portal web conocido como Atlas de Proteoma de Leucemia, diseñado por los equipos de Qutub y Kornblau con el aporte de colaboradores clínicos de todo el mundo, el portal en línea brinda a los oncólogos y científicos del cáncer las herramientas quenecesitan investigar los patrones de expresión de la proteína de AML de un paciente a otro. También proporciona a los investigadores de todo el mundo pistas para nuevas investigaciones sobre leucemia y nuevas herramientas computacionales.
Dado que muchas mutaciones genéticas no pueden ser dirigidas, el proceso de identificación de objetivos y perfiles proteómicos utilizado en este estudio de investigación acelerará la identificación de objetivos terapéuticos. También impulsa a los investigadores mucho más cerca del desarrollo de terapias combinadas personalizadas para pacientes basadas en su proteína únicafirmas
"La leucemia mielógena aguda se presenta como un cáncer tan heterogéneo que a menudo se describe como no una, sino una colección de enfermedades", dijo Qutub. "Para descifrar las pistas encontradas en las proteínas de la sangre y la médula ósea de pacientes con leucemia, desarrollamosun nuevo análisis por computadora, MetaGalaxy, que identifica los signos moleculares de la leucemia. Estos signos son análogos a la forma en que las constelaciones guían la navegación de las estrellas: proporcionan un mapa de los cambios de proteínas para la leucemia. Nuestras predicciones "características" se están probando experimentalmente a través deEl siguiente paso para llevar este trabajo a la clínica e impactar la atención del paciente es probar si estas firmas conducen al crecimiento agresivo o la resistencia a la quimioterapia observada en pacientes con leucemia.Al mismo tiempo, para acelerar rápidamente la investigación en leucemia y avanzar en la búsqueda de tratamientos, proporcionamos los sellos distintivos en un compendio en línea donde los compañeros resEarchers y oncólogos de todo el mundo pueden construir a partir de los recursos, herramientas y resultados, LeukemiaAtlas.org . "
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Texas en San Antonio . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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