En el primer análisis a gran escala de fusiones de genes de cáncer, que resultan de la fusión de dos genes previamente separados, los investigadores del Instituto Wellcome Sanger, EMBL-EBI, Open Targets, GSK y sus colaboradores han utilizado CRISPR para descubrir qué genlas fusiones son críticas para el crecimiento de las células cancerosas. El equipo también identificó una nueva fusión de genes que presenta un nuevo objetivo farmacológico para múltiples cánceres, incluidos los cánceres de cerebro y de ovario.
Los resultados, publicados hoy 16 de mayo en Comunicaciones de la naturaleza , dar más certeza para el uso de fusiones genéticas específicas para diagnosticar y guiar el tratamiento de pacientes. Los investigadores sugieren que los medicamentos existentes podrían reutilizarse para tratar a algunas personas con cánceres pancreáticos, de mama y pulmón, en función de las fusiones genéticas encontradas en sus tumores.
Las fusiones de genes, causadas por la unión anormal de dos genes diferentes, juegan un papel importante en el desarrollo del cáncer. Actualmente se utilizan como herramientas de diagnóstico para predecir cómo responderán determinados pacientes con cáncer a los medicamentos, así como los pronósticos, aestimar el resultado para un paciente que recibe la mejor atención posible. También son el objetivo de algunos de los últimos tratamientos dirigidos para el cáncer.
Los investigadores han identificado alrededor de 20,000 fusiones de genes hasta ahora, sin embargo, su función y función exactas en el desarrollo del cáncer sigue siendo poco conocida. Discriminar entre fusiones que tienen un papel en la supervivencia del cáncer y aquellas que no tienen implicaciones clínicas importantes.
En el primer estudio a gran escala de la función de fusión de genes, los investigadores del Instituto Wellcome Sanger, EMBL-EBI, Open Targets, GSK y sus colaboradores analizaron más de 8,000 fusiones de genes en más de 1,000 líneas celulares de cáncer humano, de 43 tipos diferentes de cáncertipos, incluidos los cánceres pediátricos y los cánceres con necesidad clínica insatisfecha.
El equipo probó las líneas celulares contra más de 350 medicamentos contra el cáncer para ver qué medicamentos existentes podrían reutilizarse para tratar potencialmente a pacientes con cáncer con fusiones de genes, y empleó CRISPR como una herramienta para descubrir qué fusiones de genes clave son críticas para las células cancerosassupervivencia.
El equipo encontró que el 90 por ciento de las fusiones de genes no juegan un papel esencial en el cáncer. Estos resultados deben considerarse al inferir las causas del cáncer a partir de la secuencia del genoma de los tumores de los pacientes.
El Dr. Gabriele Picco, coautor del Instituto Wellcome Sanger, dijo: "La mayoría de las fusiones de genes no son esenciales para la supervivencia de las células cancerosas. A medida que los tumores de los pacientes de secuenciación del genoma se vuelven más comunes, quienes interpretan los datos deben sercuidado al considerar si una fusión génica particular está impulsando el cáncer "
Los investigadores también descubrieron una nueva fusión, YAP1-MAML2, que es esencial para la progresión de múltiples tipos de cáncer, como los cánceres de cerebro y ovario.
El Dr. Mathew Garnett, autor principal del Instituto Wellcome Sanger y Open Targets, dijo: "Descubrimos un puñado de fusiones de genes que son clave para la supervivencia del cáncer. Estos cambios genéticos pueden presentar oportunidades para tratar pacientes con medicamentos existentes, o podrían serlos objetivos farmacológicos del futuro. Descubrimos una nueva fusión de genes, YAP1-MAML2, que ofrece un nuevo objetivo farmacológico para varios tipos de cáncer, incluido el cáncer de ovario ".
Los resultados también sugieren que las fusiones de genes que involucran RAF1, ROS1 y BRD4 podrían ser el objetivo de los medicamentos existentes, lo que significa que pueden estar disponibles nuevas opciones de tratamiento para pacientes con subtipos raros de cánceres de páncreas, mama y pulmón.
El Dr. Julio Sáez-Rodríguez, anteriormente de EMBL-EBI y Open Targets, y ahora con sede en la Universidad de Heidelberg, dijo: "Los cánceres difieren entre las personas y tener una visión genómica de estas diferencias está aumentando nuestra comprensión del cáncer y abriendo opciones de tratamientopara pacientes. Este estudio ofrece más oportunidades para emplear fusiones de genes como biomarcadores terapéuticos y estratificar a los pacientes en ensayos clínicos, ofreciendo potencialmente estudios clínicos más específicos y efectivos ".
La colaboración entre los investigadores de Sanger, EMBL-EBI y GSK, los socios de Open Targets, refuerza la traducción de estos resultados de investigación en nuevos tratamientos.
Esta investigación contribuye a construir el Mapa de Dependencia del Cáncer, un libro de reglas para el tratamiento de precisión del cáncer en el futuro.
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Materiales proporcionado por Instituto Wellcome Trust Sanger . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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