Los protocolos que permiten la transformación de líneas de células madre pluripotentes inducidas por humanos iPSC en organoides han cambiado la forma en que los científicos pueden estudiar los procesos de desarrollo y les permiten descifrar la interacción entre los genes y la formación de tejidos, particularmente para los órganos donde el tejido primario no está disponibleAhora, los investigadores están tomando esta tecnología y aplicándola para estudiar los efectos de desarrollo del ADN de Neanderthal. Los hallazgos se informan el 18 de junio en la revista Informes de células madre .
"Usar líneas iPSC para estudiar las funciones del ADN humano arcaico es un enfoque sin explotar pero muy interesante", dice el autor principal J. Gray Camp del Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva en Alemania y la Universidad de Basilea en Suiza ". Nouno ha podido ver el papel que juega el ADN de Neanderthal durante el desarrollo "
Los estudios han encontrado que aproximadamente el 2% de los genomas de los humanos modernos de fuera de África están compuestos por ADN de Neanderthal. Este ADN arcaico es el resultado del apareamiento entre los dos grupos hace decenas de miles de años.
En el nuevo estudio, el equipo utilizó recursos de la Iniciativa de células madre pluripotentes inducidas por humanos HipSci, un consorcio internacional que proporciona datos y líneas celulares para la investigación. Casi todos los datos y líneas celulares en HipSci provienen de personas del Reino Unidoy ascendencia del norte de Europa. Los investigadores analizaron este recurso de línea celular por su contenido de ADN de Neanderthal y anotaron variantes funcionales de Neanderthal para cada una de las líneas celulares.
"Algunos alelos de Neanderthal tienen una frecuencia relativamente alta en esta población", explica Camp. "Debido a eso, este recurso iPSC contiene ciertos genes que son homocigotos para los alelos de Neanderthal, incluidos los genes asociados con el color de la piel y el cabello que son altamente prevalentes en los europeos"
El equipo de Camp usó cinco líneas celulares para generar organoides cerebrales y generó datos de secuenciación de ARN de una sola célula para analizar su composición celular. Mostraron que estos datos transcriptómicos podrían usarse para rastrear ARN derivado de neandertal a través de procesos de desarrollo ". Esta es una prueba", dice Camp." El verdadero desafío será aumentar el número de líneas en un experimento, pero esto ya está comenzando a ser un estudio de primer orden que muestra que puede usar estos recursos para estudiar la actividad del ADN de Neanderthal en un proceso de desarrollo ".ser posible."
Camp señala que esta investigación podría ampliarse para estudiar otras poblaciones humanas antiguas, incluidos los denisovanos, que tienen genes que están presentes principalmente en las poblaciones de Oceanía. Su equipo también planea continuar estudiando alelos de Neanderthal utilizando HipSci y otros recursos ".se utiliza para estudiar una serie de diferentes procesos de desarrollo y fenotipos controlados por el ADN de los neandertales, incluido el tracto intestinal y la digestión, la función cognitiva y neural, y la respuesta inmune a los patógenos ", concluye.
Los investigadores han generado un navegador web con esta información para hacer que los datos sean fácilmente accesibles para futuras investigaciones.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionados por prensa celular . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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