Una sola proteína derivada de una cepa común de bacterias encontradas en el suelo ofrecerá a los científicos una forma más precisa de editar ARN.
La proteína, llamada AcrVIA1, puede detener el proceso de edición CRISPR-Cas13, según una nueva investigación de Cornell, la Universidad Rockefeller y el Centro de Cáncer Memorial Sloan Kettering publicado en la revista ciencia 3 de julio
"Estamos ampliando nuestra caja de herramientas científicas para usar eficazmente un CRISPR sin causar efectos secundarios", dijo el coautor Martin Wiedmann, Ph.D. '97, el Profesor de la Familia Gellert en Seguridad Alimentaria y director del Laboratorio de Seguridad Alimentaria de Cornell yPrograma de mejora de la calidad de la leche: "Gracias a esta bacteria, tenemos la oportunidad de desactivar y activar nuestra capacidad para realizar cambios en el ARN".
CRISPR, o las repeticiones palindrómicas cortas agrupadas regularmente espaciadas agrupadas, es un mecanismo de laboratorio que puede actuar como tijeras microscópicas y editar con precisión los genes contenidos en el ADN. Entre la media docena de tipos de CRISPR en uso hoy en día, CRISPR-Cas13 puede editar ARN, que hasta ahora no había tenido un freno en el proceso de edición.
Dado que el SARS-CoV-2, el coronavirus que causa la enfermedad COVID-19, es un virus de ARN, este nuevo accesorio de edición puede ser útil para los investigadores de coronavirus, dijeron los científicos.
El autor principal Alex Meeske, investigador postdoctoral en el laboratorio del autor principal Luciano Marraffini, profesor de la Universidad Rockefeller, sospechaba que una proteína bacteriófago alojada en Listeria podría ser útil para la edición de ARN.
Al comienzo de este estudio, Meeske contactó a Wiedmann, un experto en seguridad alimentaria, para obtener muestras bacterianas genéticas de su colección de patógenos alimentarios. El candidato al doctorado en el laboratorio Wiedmann Jingqiu Liao redujo las perspectivas de alrededor de 1,500 candidatos bacterianos a 62son.
El laboratorio de Wiedmann transfirió esas muestras a Rockefeller, donde la pasante Alice Cassel secuencia las 62 cepas y aisló 20 proteínas candidatas.
Una cepa se destacó: Listeria seeligeri, una bacteria inofensiva que se encuentra en todas partes del suelo. A diferencia de su primo feroz, el patógeno alimentado por los alimentos L. monocytogenes, no causa enfermedades humanas.
Los científicos de Rockefeller descubrieron que la proteína AcrVIA1, derivada de L. seeligeri, detuvo instantáneamente el proceso de edición CRISPR. "AcrVIA1 puede ser muy útil para controlar la aplicación de Cas13. Cualquier cosa que edite Cas13, esta proteína anti-CRISPR puedeapague ", dijo Meeske." Es un 'interruptor de interrupción' que puede usar durante el proceso de edición CRISPR, y se ha convertido en una herramienta adicional que tenemos a nuestra disposición ".
Wiedmann explicó que los científicos ahora pueden trabajar en problemas de ARN con medios más exigentes. "Esta herramienta nos da más precisión", dijo.
El documento, "Un anti-CRISPR codificado en fago permite la evasión completa de la inmunidad de tipo CRISPR-2 Cas del tipo VI", fue co-escrito por el autor principal Dinshaw J. Patel y Ning Jia, ambos de Memorial Sloan Kettering, yAlbina Kozlova de Rockefeller.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Cornell . Original escrito por Blaine Friedlander. Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
Referencia del diario :
Cita esta página :