Los investigadores descubren nuevas vías que podrían ayudar a tratar los virus de ARN

• Fecha : 22 de julio de 2020
• Fuente : Universidad de New Hampshire
• Resumen : Los investigadores han identificado nuevas vías en un virus basado en ARN donde los inhibidores, como los tratamientos médicos, se unen. El hallazgo podría ser beneficioso para comprender cómo reaccionan estos inhibidores y potencialmente ayudar a desarrollar una nueva generación de medicamentos para atacar virus con altas tasas de mortalidad,como VIH-1, Zika, Ébola y SARS-CoV2, el virus que causa COVID-19.

Investigadores de la Universidad de New Hampshire han identificado nuevas vías en un virus basado en ARN donde los inhibidores, como los tratamientos médicos, se unen. El hallazgo podría ser beneficioso para comprender cómo reaccionan estos inhibidores y potencialmente ayudar a desarrollar una nueva generación de medicamentos para atacarvirus con altas tasas de mortalidad, como VIH-1, Zika, Ébola y SARS-CoV2, el virus que causa COVID-19.

"Cuando comenzamos esta investigación, nunca anticipamos que estaríamos en medio de una pandemia causada por un virus de ARN", dijo Harish Vashisth, profesor asociado de ingeniería química. "Pero a medida que surgen estos tipos de virusCon suerte, los resultados ofrecerán una mejor comprensión de cómo los ARN virales interactúan con los inhibidores y se utilizan para diseñar mejores tratamientos ".

Al igual que la forma en que los humanos están formados por una serie de cromosomas diferentes, conocidos como ADN, muchos virus tienen una composición genética de moléculas de ARN. Estos genomas basados ​​en ARN contienen sitios potenciales donde los inhibidores pueden unir y desactivar el virus. Parte delEl desafío en el desarrollo de fármacos puede ser fluctuaciones en el genoma viral que pueden evitar que los inhibidores se adhieran.

En su artículo, publicado recientemente en el Revista de Cartas de Química Física , los investigadores observaron específicamente un fragmento de ARN del virus VIH-1 y su interacción con un ligando / inhibidor, un compuesto complejo que se sabe que interfiere con el proceso de replicación del virus. Mediante el modelado por computadora, los investigadores descubrieron las vías deEl inhibidor se desligó del ARN viral en varios eventos raros que inesperadamente mostraron un movimiento coordinado en muchas partes del bolsillo de unión que son los componentes básicos del ARN. Los científicos se centraron en los elementos estructurales del genoma del ARN del VIH-1 porque se consideranUn buen modelo para estudiar los mismos procesos en una amplia gama de virus de ARN. Los investigadores realizaron simulaciones a nivel molecular de las raras acciones estructurales y conformacionales del proceso de unión / desunión que a menudo son difíciles de observar utilizando métodos experimentales en el laboratorio.

"Observamos lo que se llaman eventos raros de cambio de base involucrados en el proceso de unión / desunión del inhibidor que proporcionó los nuevos detalles del mecanismo subyacente de este proceso", dijo Vashisth. "Nuestra esperanza es que esto agregue nuevas posibilidades a un campotradicionalmente enfocado en estructuras biomoleculares estáticas y conducir a nuevos medicamentos "

Fuente de la historia :

Materiales proporcionado por Universidad de New Hampshire . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.

Referencia del diario :

1. Lev Levintov, Harish Vashisth. El reconocimiento de ligando en el ARN viral necesita transiciones conformacionales raras . The Journal of Physical Chemistry Letters , 2020; 11 14: 5426 DOI: 10.1021 / acs.jpclett.0c01390