Determinar qué peces viven en varios cuerpos de agua puede ser una tarea desalentadora para los científicos que estudian esas poblaciones. Identificar especies invasoras o en peligro de extinción, por ejemplo, a menudo se ha basado en la capacidad de atraparlas.
Ahora, según un nuevo estudio publicado en Métodos en ecología y evolución , los investigadores han mejorado su método de seguimiento de especies mediante el uso del material biológico que esos organismos dejan conocido como ADN ambiental eDNA.
Los rastros de eDNA contienen la misma información vital que una muestra de ADN directa, como una muestra de sangre o tejido. Piense en el trabajo realizado por científicos forenses, que pueden identificar a individuos de un mechón de cabello.
Hasta ahora, los investigadores creían que el ADN desprendido por los organismos en sus ambientes acuosos estaba significativamente degradado y de baja calidad, lo que dificultaba tomar esos fragmentos y relacionarlos con una especie específica.
Resulta que las células que los peces arrojan al agua protegen el ADN firmemente enrollado.
"Tuvimos éxito en detectar y trabajar con piezas de ADN largas e intactas", dijo Michael E. Pfrender, director del Centro de Genómica y Bioinformática y profesor asociado en el Departamento de Ciencias Biológicas y la Iniciativa de Cambio Ambiental de la Universidadde Notre Dame ". Esto cambia por completo la opinión predominante de que solo podemos trabajar con fragmentos cortos de ADNc altamente degradado. Ahora, podemos comenzar a utilizar la información extraída de estas largas cadenas de ADN para desarrollar identificaciones de especies más precisas y detectar variaciones genéticasdentro de las especies "
Los investigadores recolectaron muestras de agua de lagos, lagunas y arroyos del área y utilizaron la tecnología de reacción en cadena de la polimerasa PCR para amplificar, o copiar, los genomas mitocondriales completos del ADNc encontrado en esos entornos.
A través de este método mejorado, los científicos pueden obtener una imagen más detallada de la biodiversidad en varios hábitats acuáticos.
"Hay un esfuerzo continuo para poblar bases de datos como el Genbank del Centro Nacional de Información Biotecnológica NCBI", dijo Pfrender. "No tenemos firmas genéticas para toda la biodiversidad que nos gustaría monitorear. Estas bases de datos son críticas paraayudándonos a identificar las diversas especies que viven dentro de estas comunidades "
El método utilizado en el estudio no solo es más preciso, es más eficiente cuando se trata de buscar y manejar especies invasoras.
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Materiales proporcionado por Universidad de Notre Dame . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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