Una modificación desconcertante del ADN que es común en las bacterias no está presente en humanos u otros mamíferos. Esto ha sido demostrado en un nuevo estudio realizado por científicos de la Universidad de Linköping en Suecia, publicado en Avances científicos . El estudio muestra que la detección de la marca epigenética 6mdA en animales fue probablemente el resultado de las limitaciones de la tecnología utilizada y la contaminación bacteriana de las muestras.
Hace unos años, se publicaron algunos estudios que despertaron un considerable interés entre los investigadores en genética. Estos estudios habían examinado una marca epigenética particular, o modificación del ADN que influye en cómo se usa la secuencia de ADN en diferentes células. Esta marca no teníapreviamente se observó en organismos multicelulares. La marca, conocida como "6mdA", es, por el contrario, común en las bacterias, donde juega un papel importante en la protección de las bacterias contra los virus. Informes de numerosos grupos de investigación que indican que habían encontrado 6mdA enVarias especies animales, e incluso en células humanas, estimularon no solo un gran interés entre la comunidad investigadora, sino también algunas preguntas. Una de ellas se refería a los niveles de 6mdA detectados, que eran tan bajos que los científicos se preguntaban si una señal epigenética tan rara podría realmentetienen una función. Después de estos informes iniciales, algunos otros estudios publicados no pudieron detectar 6 mdA en animales.
Al igual que muchos otros grupos de investigación, el grupo de Colm Nestor en la Universidad de Linköping comenzó a estudiar esta desconcertante señal epigenética. Sin embargo, no pudieron detectarla en células humanas o de ratón. Finalmente, detectaron 6 mdA en dos muestras de células humanas,pero resultó que ambas muestras estaban contaminadas con bacterias micoplasma. Los investigadores sospecharon que la marca epigenética provenía de las bacterias y no de las células humanas. Trataron las células con antibióticos contra el micoplasma y vieron desaparecer la señal de 6 mdA.
Los investigadores de LiU creen que la contaminación con la bacteria micoplasma es un problema subestimado en la investigación epigenética. La cepa particular de micoplasma que encontraron es común en personas sanas y, por lo general, no causa ningún efecto negativo sobre la salud. Dado que la bacteria micoplasma puede existir no solo fuera de las célulaspero también dentro de las células del cuerpo, puede ser que esta bacteria esté presente, pero no detectada, en muestras humanas. Para la mayoría de los tipos de bacterias, los investigadores pueden detectar fácilmente si las células cultivadas en el laboratorio están contaminadas. Sin embargo, este no es el casopara la contaminación por micoplasma, que requiere pruebas especiales.
Los investigadores de LiU pronto descubrieron que no solo las bacterias micoplasma causan problemas a los investigadores que estudian la marca 6mdA. También encontraron problemas con varios métodos utilizados para detectar esta modificación epigenética.
"Nos dimos cuenta de que las 'señales' de 6 mdA detectadas por estas técnicas eran simplemente ruido. Sin embargo, como consecuencia de varios problemas técnicos complejos, el ruido de fondo en varios de los métodos no era aleatorio, sino que parecía ser una señal verdadera. Ahorapodemos decir sin lugar a dudas que 6mdA no está presente en los mamíferos ", dice Colm Nestor, investigador en el Departamento de Ciencias Biomédicas y Clínicas de la Universidad de Linköping y líder del estudio.
Colm Nestor sostiene que los informes de 6mdA en mamíferos provienen de estudios bien ejecutados publicados en revistas científicas acreditadas. Es extremadamente inusual que varios métodos den resultados engañosos similares como resultado de artefactos completamente diferentes.
"Cuando analizamos fenómenos muy raros, debemos ser extremadamente cuidadosos y considerar si realmente podemos medirlos utilizando los métodos que hemos elegido. Con respecto a 6 mdA, se puede ahorrar mucho tiempo y dinero, y mucha decepciónevitado, si los investigadores dejan de estudiar algo que simplemente no existe ", dice Colm Nestor.
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Materiales proporcionado por Universidad de Linköping . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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