Para sus tareas vitales, todas las moléculas de ARN en nuestras células requieren proteínas como socios de unión. Científicos del Centro Alemán de Investigación del Cáncer Deutsches Krebsforschungszentrum, DKFZ y colegas del Laboratorio Europeo de Biología Molecular EMBL han desarrollado el primer método con el quepueden analizar la composición de toda la red de proteínas de ARN de la célula. El nuevo método ha sido publicado en la revista científica Celda .
Las moléculas de ARN realizan tareas vitales en cada célula: el ARN mensajero ARNm ayuda a traducir la información genética almacenada en el ADN en proteínas. Sin embargo, existen muchas otras moléculas de ARN que no se están traduciendo en proteínas. De hecho, solo cincoporcentaje de ARN en una célula humana es ARNm.
Para muchas de sus funciones, las moléculas de ARN tienen que interactuar con las proteínas. A veces, diferentes tipos de ARN se unen con proteínas específicas para formar máquinas moleculares altamente complejas, el mejor ejemplo es el ribosoma donde tiene lugar la síntesis de proteínas.
"Una red gigantesca de ARN y proteínas que interactúan está activa en cada una de nuestras células, pero todavía sabemos muy poco acerca de la composición exacta de esta red. Queremos entender qué proteínas se unen a los ARN y cómo esto difiere entre los tipos de células, o en condiciones en que las células están estresadas. Ahora hemos desarrollado un método que nos permite investigar esto por primera vez ", dice Jeroen Krijgsveld del DKFZ.
Hasta ahora, tales análisis solo podían llevarse a cabo para una clase de ARN, a saber, ARNm. Los ARNm son las plantillas que instruyen la secuencia de proteínas. Interacciones de proteínas con todos los otros tipos de ARN no codificantes, algunos de los cuales solo han sidoconocido por algunos años, no se pudo detectar utilizando el método existente. "Los ARN no codificantes superan con creces a las moléculas de ARNm, y cumplen varios propósitos reguladores", explica Krijgsveld.
Junto con colegas de EMBL, Krijgsveld ahora ha logrado desarrollar un método denominado XRNAX para analizar las interacciones de todas las clases de ARN con proteínas celulares. Usando XRNAX, los científicos también pueden hacer declaraciones cuantitativas: no solo pueden ver qué proteína se une al ARNpero también en qué medida. De esta manera, pudieron observar cómo cambia la unión del ARN cuando las células están expuestas a una toxina. Además, con el nuevo método, el equipo de investigación identificó cientos de proteínas que anteriormente no se unían al ARN.
"Con XRNAX somos capaces de medir todas las interacciones entre proteína y ARN, que es algo que nadie podría medir antes", explica Jakob Trendel, quien desarrolló XRNAX. "Se sospecha que muchas interacciones proteína-ARN son la causa subyacente de enfermedades que incluyencáncer, esclerosis lateral amiotrófica o infecciones virales como el VIH. Ahora tenemos una forma de verlos ".
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Materiales proporcionado por Centro Alemán de Investigación del Cáncer Deutsches Krebsforschungszentrum, DKFZ . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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