El software de realidad virtual que permite a los investigadores 'caminar' dentro y analizar células individuales podría usarse para comprender problemas fundamentales en biología y desarrollar nuevos tratamientos para enfermedades.
El software, llamado vLUME, fue creado por científicos de la Universidad de Cambridge y la empresa de software de análisis de imágenes 3D Lume VR Ltd. Permite visualizar y analizar datos de microscopía de superresolución en realidad virtual, y se puede utilizar para estudiar tododesde proteínas individuales hasta células completas. Los detalles se publican en la revista Métodos de la naturaleza .
La microscopía de superresolución, que recibió el Premio Nobel de Química en 2014, permite obtener imágenes a nanoescala utilizando ingeniosos trucos de la física para sortear los límites impuestos por la difracción de luz. Esto ha permitido a los investigadores observarprocesos a medida que ocurren. Sin embargo, un problema ha sido la falta de formas de visualizar y analizar estos datos en tres dimensiones.
"La biología ocurre en 3D, pero hasta ahora ha sido difícil interactuar con los datos en una pantalla de computadora 2D de una manera intuitiva e inmersiva", dijo el Dr. Steven F. Lee del Departamento de Química de Cambridge, quien dirigió la investigación. "No fue hasta que comenzamos a ver nuestros datos en realidad virtual que todo encajó en su lugar".
El proyecto vLUME comenzó cuando Lee y su grupo se reunieron con los fundadores de Lume VR en un evento de participación pública en el Museo de Ciencias de Londres. Si bien el grupo de Lee tenía experiencia en microscopía de superresolución, el equipo de Lume se especializó en computación espacial y datosanálisis, y juntos pudieron desarrollar vLUME en una nueva y poderosa herramienta para explorar conjuntos de datos complejos en realidad virtual.
"vLUME es un software de imágenes revolucionario que lleva a los humanos a la nanoescala", dijo Alexandre Kitching, director ejecutivo de Lume. "Permite a los científicos visualizar, cuestionar e interactuar con datos biológicos 3D, en tiempo real, todo dentro de un entorno de realidad virtual, paraencontrar respuestas a preguntas biológicas más rápido. Es una nueva herramienta para nuevos descubrimientos ".
Ver los datos de esta manera puede estimular nuevas iniciativas e ideas. Por ejemplo, Anoushka Handa, una estudiante de doctorado del grupo de Lee, utilizó el software para obtener imágenes de una célula inmunitaria extraída de su propia sangre y luego colocada dentro de su propia célula.en realidad virtual. "Es increíble, te da una perspectiva completamente diferente de tu trabajo", dijo.
El software permite que se carguen múltiples conjuntos de datos con millones de puntos de datos y encuentra patrones en los datos complejos utilizando algoritmos de agrupación integrados. Estos hallazgos se pueden compartir con colaboradores en todo el mundo utilizando funciones de imagen y video en el software.
"Los datos generados a partir de microscopía de súper resolución son extremadamente complejos", dijo Kitching. "Para los científicos, ejecutar el análisis de estos datos puede llevar mucho tiempo. Con vLUME, hemos logrado reducir enormemente ese tiempo de espera permitiendo pruebas más rápidasy análisis. "
El equipo utiliza principalmente vLUME con conjuntos de datos biológicos, como neuronas, células inmunes o células cancerosas. Por ejemplo, el grupo de Lee ha estado estudiando cómo las células antigénicas desencadenan una respuesta inmunitaria en el cuerpo ". Segmentando y viendo los datos en vLUME, hemos podido descartar rápidamente ciertas hipótesis y proponer otras nuevas ", dijo Lee. Este software permite a los investigadores explorar, analizar, segmentar y compartir sus datos de nuevas formas. Todo lo que necesita es un visor de realidad virtual".
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Materiales proporcionado por Universidad de Cambridge . La historia original tiene la licencia a Licencia Creative Commons . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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