Una nueva secuencia completa del genoma del pez caracol Yap hadal proporciona información sobre cómo el pez inusual sobrevive en algunas de las partes más profundas del océano. Xinhua Chen de la Universidad de Agricultura y Silvicultura de Fujian y Qiong Shi de la Academia de Ciencias Marinas de BGI publicaronsu análisis del nuevo genoma el 13 de mayo en la revista PLOS Genetics .
Los animales que viven en ambientes de aguas profundas enfrentan muchos desafíos, que incluyen altas presiones, bajas temperaturas, poca comida y casi ninguna luz. Los peces son los únicos animales con columna vertebral que viven en la zona abisal, definida como profundidades por debajo de los 6.000 metros.- y los peces caracoles hadal viven en al menos cinco trincheras marinas separadas. Chen, Shi y sus colegas construyeron una secuencia del genoma completo de alta calidad a partir del pez caracol Yap hadal para comprender cómo se ha adaptado a la vida en las profundidades marinas. El pez fue capturado dela Fosa de Yap en el Océano Pacífico occidental a una profundidad de unos 7.000 metros.
El análisis del nuevo genoma reveló múltiples adaptaciones para vivir en un ambiente frío, oscuro y de alta presión. El pez caracol lleva genes adicionales para la reparación del ADN, lo que puede ayudar a mantener intacto su genoma bajo altas presiones. También tiene cinco copias de ungen de una enzima que toma un compuesto producido por bacterias en su intestino y lo transforma en uno que estabiliza la estructura de las proteínas bajo alta presión hidrostática. El pez caracol también ha perdido ciertos genes involucrados en la visión, el gusto y el olfato, que probablemente sean innecesarios ensu entorno oscuro, con comida limitada.
Estos nuevos hallazgos ofrecen pistas sobre los mecanismos que han desarrollado los peces caracoles para sobrevivir en las trincheras oceánicas. Sin embargo, los investigadores señalan que se necesitarán más estudios para confirmar las funciones de estos cambios genéticos. Además, la secuencia del genoma de alta calidad puedesirven como recurso para futuras investigaciones en profundidad de los peces caracoles y otros animales que viven en la zona abisal.
Chen agrega: "Muchos genes asociados con la reparación del ADN muestran evidencia de selección positiva y han ampliado el número de copias en el genoma del pez caracol Yap hadal, lo que potencialmente refleja la dificultad de mantener la integridad del ADN bajo alta presión hidrostática. Las cinco copias de la trimetilaminaLa enzima generadora de N-óxido TMAO que contiene el gen de la monooxigenasa-3 fmo3 y la abundancia de bacterias generadoras de trimetilamina TMA en el intestino del pez caracol Yap hadal podrían proporcionar suficiente TMAO para mejorar la estabilidad de las proteínas en condiciones abisales ".
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Materiales proporcionados por PLOS . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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