Dos estudios dirigidos por el Translational Genomics Research Institute TGen y la University of California San Francisco UCSF documentan cómo un nuevo enfoque de secuenciación genética avanzada puede ayudar a frustrar la creciente amenaza mundial que plantean las mutaciones de la tuberculosis TB resistentes a los medicamentos.
Si bien la tuberculosis ha disminuido en los EE. UU. Y otras naciones desarrolladas, la bacteria pulmonar infecciosa sigue siendo una gran amenaza para la salud pública en los países en desarrollo, y se estima que infecta a un tercio de la población mundial. La amenaza de la tuberculosis está aumentando en algunos lugares a medida que las versiones mutantesde la enfermedad se vuelven cada vez más resistentes a los tratamientos farmacológicos actuales.
"Creemos que las nuevas tecnologías de secuenciación dirigida pueden ayudar a los médicos a brindar atención personalizada a los pacientes con TB resistente a los medicamentos", dijo el Dr. David Engelthaler, codirector de la División de Genómica de Patógenos de TGen y autor principal de ambos estudios.la resistencia ocurre cuando se recetan los antibióticos equivocados en el momento equivocado. Este nuevo enfoque está diseñado no solo para ayudar a los médicos a tratar mejor a los pacientes, sino para ayudar a disminuir o detener la amenaza global de la tuberculosis resistente a múltiples medicamentos ".
Uno de los estudios TGen-UCSF, "Cryptic Microhetherresistance Explains M. tuberculosis Phenotypic Resistance", publicado el 14 de junio en la Revista estadounidense de medicina respiratoria y de cuidados intensivos , concluye que el uso de "un enfoque de secuenciación de próxima generación NGS dirigido ... reduce drásticamente el error de secuenciación". Dicho error, inherente a los sistemas de secuenciación de ADN, impediría de otro modo la capacidad de detectar poblaciones ocultas muy pequeñas de fármacos resistentesbacterias que crecen en el pulmón.
En ambos estudios, el equipo de TGen-UCSF utilizó la tecnología de lectura superpuesta de molécula única SMOR, inventada en TGen, que identifica con precisión variantes de TB, incluso en los casos en que una tecnología más antigua, conocida como secuenciación de Sanger, no encontrómutaciones resistentes a fármacos.
Se está desarrollando una versión de esta prueba SMOR que podría implementarse fácilmente en áreas subdesarrolladas donde puede ser más necesaria.
"Actualmente se está desarrollando una versión de nuestro ensayo basada en un kit fácil de usar para usar con los nuevos secuenciadores de ADN de escritorio para realizar pruebas rápidas de susceptibilidad a los medicamentos en entornos de recursos limitados", dijo el Dr. Engelthaler. "Parece contradictorio desarrollar tecnología de puntasoluciones genómicas para problemas en nuestro mundo subdesarrollado, pero estamos adaptando esa tecnología de manera que cualquiera pueda acceder a ella, casi en cualquier lugar ".
La identificación de las cepas de tuberculosis resistentes a los medicamentos que muta rápidamente es el mayor desafío para erradicar esta enfermedad, que en 2015 infectó a 10,4 millones y mató a 1,8 millones de personas en todo el mundo, según los Centros para el Control de Enfermedades de EE. UU. Y la Organización Mundial de la Salud.- casi 5,000 muertes por día en todo el mundo.
"A pesar de nuestra sociedad ahora global, para muchos de nosotros es difícil imaginar lugares donde una infección, completamente curable con antibióticos desarrollada hace décadas, pueda matar a más personas en su mejor momento que el cáncer. Desafortunadamente, debido a los sistemas de salud en el extranjero debilitados pornegligencia y falta crónica de fondos, la tuberculosis altamente resistente se está convirtiendo en la "nueva tuberculosis normal". Dado que somos y siempre hemos sido un país "crisol" y un faro de esperanza para muchos, sin duda veremos estos casos en los Estados Unidos.", dijo el Dr. John Metcalfe, especialista en cuidados pulmonares y profesor asociado de la Facultad de Medicina de UCSF, y autor principal de los dos estudios TGen-UCSF.
El segundo estudio TGen-UCSF - El subcultivo de Mycobacterium tuberculosis da como resultado la pérdida de heterorresistencia potencialmente relevante desde el punto de vista clínico - publicado el 11 de septiembre en la revista Agentes antimicrobianos y quimioterapia , también usó la secuenciación SMOR de "próxima generación ultraprofunda" para examinar variantes de TB potencialmente resistentes a los medicamentos.
"Este informe documenta aún más la naturaleza previamente descrita del impulso del organismo M. tuberculosis para mutar y volverse resistente a nuestros antibióticos", dijo el Dr. Metcalfe, "y enfatiza aún más la necesidad de un estudio adicional de los efectos deeste fenómeno tanto en el diagnóstico clínico como en los resultados del paciente ".
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Materiales proporcionado por Instituto de Investigación de Genómica Traslacional . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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