Con el final de Halloween, hoy es tradicionalmente el día en que salen las decoraciones navideñas, por lo que es apropiado que un animal icónico asociado con la fiesta salte al espíritu navideño al unirse a la lista de especies para secuenciar su genoma.Publicado hoy en la revista de acceso abierto GigaScience , es un artículo que describe la secuencia y el análisis del genoma de los renos. Este trabajo, aunque es poco probable que revele por qué los renos de Santa puede volar, proporciona un gran recurso para obtener una mayor comprensión de los procesos de evolución, domesticación, cría de animales y adaptacióna ambientes extremos.
El reno Rangifer tarandus es la única especie completamente domesticada en la familia de los ciervos, o Cervid.También es el único ciervo que tiene una distribución mundial: abarcando regiones boreales, tundra, subárticas, árticas y montañosas del norte de Asia, América del Norte y Europa.A diferencia de todos los otros cérvidos, no solo los ciervos machos crecen y arrojan astas, sino también las hembras.Desde el punto de vista de la cría de animales, la leche de reno es mucho más rica en proteínas y tiene menos lactosa que la leche de vaca.El último aspecto hace que la disponibilidad de esta leche sea de interés dado el alto porcentaje de personas intolerantes a la lactosa en el mundo.Con esta variedad de características únicas, la disponibilidad de una secuencia del genoma de los renos puede proporcionar un trineo completo lleno de información nueva, y es un nuevo miembro bienvenido al club de élite de especies domesticadas con genomas de referencia, como la vaca, la oveja y la cabra.
Este trabajo fue realizado por un equipo de investigadores chinos de la Academia China de Ciencias Agrícolas en Changchun y la Universidad Politécnica del Noroeste en Xi'an. Los investigadores tomaron una muestra de sangre de un reno hembra de dos años de edad, de unLa manada domesticada mantenida por los cazadores pastores nómadas de Ewenki en las montañas del Gran Khingan en China. Secuenciaron, ensamblaron, anotaron el genoma y demostraron que era de alta calidad. La comparación del genoma de los renos con los genomas de especies relacionadas y con los humanos, reveló queel tamaño del genoma del reno 2.6 GB o 2.6 mil millones de pares de bases es ligeramente más pequeño que el de los humanos, vacas y cabras, y aproximadamente del mismo tamaño que el de las ovejas.
El primer autor del artículo, Zheping Li, profesor asociado del Instituto de Ciencias Animales y Vegetales Especiales de la Academia China de Ciencias Agrícolas, señaló que el análisis también identificó "335 genes específicos de renos que probablemente ayudarán a comprender el especialcaracterísticas biológicas de los renos. Estos también podrían ser muy útiles para comprender la evolución de los renos y de toda la familia Cervid en futuros estudios de genómica comparativa entre renos y otros rumiantes ".
Con este objetivo en mente, los investigadores también construyeron un árbol evolutivo utilizando el nuevo genoma y los genomas ya disponibles de miembros de la familia bovina. Descubrieron que los renos, el ganado y las cabras se separaron de un antepasado común hace aproximadamente 29,6 millones de añosEsto fue durante la época del Oligoceno, donde uno de los principales cambios fue la expansión global en los pastizales.
Este artículo fue uno de los ganadores de la inauguración GigaScience concurso y premio que se utiliza para promover nuevas investigaciones de vanguardia. Los autores presentaron su trabajo en una sesión especial en la XII Conferencia Internacional Anual de Genómica de BGI en Shenzhen el viernes 27 de octubre. Como concurso de ciencia abierta esto ylos artículos de los otros ganadores fueron revisados de manera totalmente abierta, donde el público podía seguir todo el proceso de publicación desde que el borrador del artículo estuviera disponible abiertamente en el servidor de preimpresión de Biorxiv, el proceso de revisión por pares realizado en vivo con las revisiones disponibles antes de la publicacióndecisión en el sistema de revisión de superposición de Academic Karma, seguida de decisiones editoriales, revisiones de manuscritos y publicación de artículos con toda la correspondencia del editor, autor y revisor disponible con el artículo publicado.
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Materiales proporcionados por Oxford University Press, EE. UU. . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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