El virus Zika circuló en muchas regiones de las Américas durante varios meses antes de que se detectaran casos de infección, según los nuevos datos de un equipo de investigación internacional del Broad Institute of MIT y Harvard y varias instituciones colaboradoras.
Estos hallazgos, revelados hoy en Naturaleza en un artículo dirigido por Pardis Sabeti del Broad Institute y la Universidad de Harvard, surge de un análisis de 174 genomas del virus del Zika, incluida la mayor colección de genomas del virus del Zika hasta la fecha, secuenciado a partir de muestras de pacientes y mosquitos recolectadas en 11países y territorios afectados.
Los datos genómicos permitieron al equipo de investigación reconstruir por primera vez la propagación del virus en América del Sur y Central, el Caribe y el sur de los Estados Unidos.
En muchas de estas regiones, el virus circulaba durante meses antes de que se detectaran casos locales de infección. El análisis de Sabeti y sus colegas sugirió que el Zika estaba circulando en Brasil alrededor de febrero de 2014, un año antes de que se informaran las primeras infecciones confirmadas de esa nación. Del mismo modo,El virus parece haber llegado a Colombia, Honduras, Puerto Rico y otras partes del Caribe entre 4,5 y 9 meses antes de las primeras infecciones locales confirmadas, lo que destaca la importancia de contar con herramientas de diagnóstico sensibles y específicas al inicio de un brote.
Estos resultados aparecen solo ahora, meses después del pico del brote, porque la secuenciación del virus Zika ha resultado ser un desafío, particularmente directamente de muestras de pacientes. La dificultad surge porque el virus Zika generalmente está presente en niveles muy bajos en los pacientes y desaparece rápidamenteComo resultado, se habían generado muy pocos genomas de Zika antes de este estudio, lo que deja a los investigadores con pocas bases para comprender cómo se está propagando y evolucionando el virus.
Para abordar esta falta de datos, el equipo desarrolló nuevos métodos analíticos y de laboratorio para capturar datos genómicos sólidos del Zika, y los aplicó a muestras recolectadas en colaboración con colaboradores en Brasil, Colombia, República Dominicana, Honduras, Jamaica, Puerto Rico,Massachusetts y Florida generarán 110 genomas nuevos para este estudio. El equipo combinó esos genomas con 64 adicionales disponibles en GenBank y en uno de los dos documentos complementarios del estudio para llevar a cabo su análisis.
"Sabíamos que era importante comprender las poblaciones virales que impulsan la epidemia, lo que nos motivó a enfrentar los desafíos de secuenciar Zika", dijo el coautor del estudio, Hayden Metsky, un estudiante graduado en el laboratorio Sabeti. "Porque los datosgeneramos capturar la diversidad geográfica del virus en las Américas, brindan la oportunidad de rastrear cómo y cuándo se propagó el virus. Nuestros datos y hallazgos también respaldarán el desarrollo de pruebas de diagnóstico molecular más efectivas, así como herramientas mejoradas de vigilancia de salud pública."
El trabajo también destaca la importancia de crear rápidamente alianzas confiables entre investigadores y entre instituciones y regiones, y de compartir datos abiertamente durante los brotes.
"Esta colaboración ha sido sobre cada socio que comparte sus recursos y experiencia únicos - muestras, protocolos, análisis, ideas - para ayudar a comprender y combatir el Zika", dijo Thiago Moreno L. Souza, autor principal y senior del estudiocientífico investigador de la Fundação Oswaldo Cruz en Río de Janiero, Brasil. "Compartir los datos ampliamente para el mismo objetivo final era una extensión obvia de ese espíritu".
El estudio fue publicado junto con dos documentos complementarios, uno por Kristian Andersen del Instituto de Investigación Scripps y colegas que examinaron la introducción del Zika en Florida, y el otro por Oliver Pybus en la Universidad de Oxford y colegas que examinaron el establecimiento del virus y su propagación temprana dentro dey más allá del noreste de Brasil. Los tres equipos se comprometieron a compartir datos e ideas libremente entre ellos y a divulgar sus hallazgos de manera cooperativa y rápida.
"En conjunto, nuestro objetivo era capturar una imagen lo más completa posible de los fundamentos genéticos de la epidemia en las Américas. Trabajar juntos fue fundamental para alcanzar ese objetivo", dijo el coautor del estudio, Bronwyn MacInnis, director asociado de malariay genómica viral en el Programa de Microbiomas y Enfermedades Infecciosas de Broad. "En lugar de competir por la publicación, queríamos que nuestros documentos se aprovecharan mutuamente y reflejaran nuestro compromiso con el bien común".
El zika sigue siendo una amenaza importante para la salud pública en los países y regiones afectados, lo que pone de relieve la necesidad de continuar la vigilancia y la investigación sobre el virus. Según MacInnis, la epidemia ofrece lecciones sobre el papel que puede desempeñar la genómica en la identificación y el seguimiento de brotes emergentes antes, antesse produce una infección generalizada
"La genómica nos permitió reconstruir cómo viajó el virus y cómo cambió a través de la epidemia, lo que también significa que la genómica podría haber ayudado a detectarlo mucho antes", dijo. "Estábamos muy por detrás de la curva del Zika. Necesitamos estarmucho antes de la próxima amenaza viral emergente, y la genómica puede tener un papel en lograr esto "
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Materiales proporcionado por Instituto Amplio del MIT y Harvard . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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