Científicos del Centro de Biomedicina de Sistemas de Luxemburgo de la Universidad de Luxemburgo han desarrollado un método para analizar el genoma de las células cancerosas con más precisión que nunca. El equipo dirigido por el Prof. Antonio del Sol, jefe del grupo de investigación Biología Computacional,está empleando bioinformática: utilizando procesos informáticos novedosos, los investigadores han creado modelos del genoma de las células cancerosas basándose en cambios conocidos en el genoma. Estos modelos son útiles para determinar la estructura del ADN en los tumores. "Si conocemos esta estructura, podemosestudiar cómo se desarrolla y propaga el cáncer ", dice del Sol." Esto nos da pistas sobre posibles puntos de partida para desarrollar nuevos medicamentos contra el cáncer y una mejor terapia individual para los pacientes con cáncer ". Los investigadores de LCSB publicaron recientemente sus resultados en la revista científica Investigación de ácidos nucleicos .
"La causa de los cánceres son cambios en el ADN", dice Sarah Killcoyne, quien está haciendo su doctorado en la Universidad de Luxemburgo y cuya tesis doctoral es un componente central del proyecto de investigación. "Surgen mutaciones, los cromosomas pueden romperse ose vuelven a ensamblar en el orden incorrecto, o se pueden perder partes del ADN ", Killcoyne describe la catástrofe celular:" En el peor de los casos, el genoma se vuelve completamente caótico ". Las células afectadas se vuelven incapaces de realizar su función en el cuerpo y -- quizás incluso peor - se multiplican perpetuamente. El resultado es cáncer.
Si vamos a desarrollar nuevos medicamentos contra el cáncer y brindar una terapia personalizada, es importante conocer la estructura del ADN en las células cancerosas. Los oncólogos y científicos han aislado cromosomas de tumores y los han analizado bajo el microscopio durante décadas. Encontraron que las irregularidades enla estructura cromosómica a veces indicaba el tipo de cáncer y la terapia correspondiente. "Las tecnologías de secuenciación han hecho que la identificación de muchas mutaciones sea más precisa, mejorando significativamente nuestra comprensión del cáncer", dice Sarah Killcoyne. "Pero ha sido mucho más difícil usar estastecnologías para comprender los caóticos cambios estructurales en el genoma de las células cancerosas ".
Esto se debe a que las máquinas de secuenciación solo entregan datos sobre fragmentos de ADN muy cortos. Para reconstruir el genoma, los científicos necesitan una secuencia de referencia, una especie de plantilla con la que armar el rompecabezas del genoma secuenciado. Killcoyne continúa:"La secuencia de referencia nos da pistas sobre dónde se superponen los fragmentos y en qué orden pertenecen juntos". Dado que la secuencia de genes en las células cancerosas está completamente desordenada, lógicamente, no hay una secuencia de referencia única. "En su lugar, desarrollamos múltiples referencias".dice Sarah Killcoyne. "Aplicamos métodos estadísticos para nuestro nuevo enfoque bioinformático, para generar modelos o referencias de genomas caóticos y para determinar si realmente nos muestran los cambios estructurales en el genoma de un tumor".
Estos métodos son de doble importancia para el líder del grupo del Sol, ya que afirma: "En primer lugar, el trabajo de Sarah Killcoyne es importante para la investigación del cáncer. Después de todo, estos modelos se pueden utilizar para investigar las causas de los procesos genéticos y moleculares en la investigación del cáncer.y desarrollar nuevos enfoques terapéuticos. En segundo lugar, estamos interesados en el desarrollo del modelo bioinformático para volver a aplicarlo a otras enfermedades que tienen causas genéticas complejas, como enfermedades neurodegenerativas como el Parkinson. Aquí también queremos comprender mejor las relaciones entre mutaciones genéticas ylos procesos metabólicos resultantes. Después de todo, los nuevos enfoques para diagnosticar y tratar las enfermedades neurodegenerativas son un objetivo importante en el Centro de Biomedicina de Sistemas de Luxemburgo ".
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Materiales proporcionado por Universidad de Luxemburgo . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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