Hay millones de especies de hongos, y esos pocos cientos encontrados en el Aspergillus el género juega papeles importantes en áreas que van desde la producción industrial hasta los patógenos de plantas agrícolas. Reportado el 22 de octubre de 2018, en Genética de la naturaleza , un equipo dirigido por científicos de la Universidad Técnica de Dinamarca, el Instituto Conjunto del Genoma JGI del Departamento de Energía de los EE. UU. DOE, un Centro de Usuarios de la Oficina de Ciencia del DOE y el Instituto Conjunto de Bioenergía JBEI, una Bioenergía del DOECentro de Investigación, presente el primer gran análisis de un Aspergillus subgrupo de hongos, sección Nigri.
" Aspergillus es un género tan importante, no solo para la biotecnología, sino para todos los papeles que desempeña en la agricultura, la salud humana, la producción de enzimas y la fermentación de alimentos ", dijo el coautor del estudio Scott Baker, líder del área de ciencias en el Laboratorio de Ciencias Moleculares Ambientales, una instalación de usuarios nacionales en el Laboratorio Nacional del Noroeste del Pacífico y miembro del grupo de biotecnología fúngica de JBEI. "Es la navaja suiza de los géneros de hongos en cuanto a su impacto en cosas que son importantes para nosotros".
Los resultados son parte de un proyecto a largo plazo para secuenciar, anotar y analizar los genomas de más de 300 Aspergillus hongos. Seis genomas de hongos dentro de la sección Nigri ya habían sido secuenciados previamente; JGI secuenciado y anotado 23 genomas de hongos adicionales dentro del subgrupo. Estos incluían genomas de 20 especies y aislamientos múltiples de la misma especie, Aspergillus niger. El compendio resultante permite a los investigadores realizar comparaciones intraespecies dentro de la sección Nigri, así como comparar los genomas fúngicos dentro del subgrupo con otros genomas dentro del Aspergillus género
Estudiar la diversificación de especies
"La comparación dentro y a través de una sección taxonómica nos permite construir un perfil genético para esa sección, que se puede conectar a los fenotipos características conocidas de la especie en la sección", dijo el autor principal del estudio, Mikael Andersen, de la Universidad Técnicade Dinamarca. "Esto es bastante útil en muchos aspectos; por ejemplo, para identificar nuevas enzimas únicas o para vincular un compuesto bioactivo interesante a los genes biosintéticos. Esto allana el camino para nuevas fábricas de células sostenibles".
Baker agregó que las comparaciones intraespecies dentro del subgrupo ofrecen a los investigadores la oportunidad de estudiar la diversificación de especies y profundizar en la evolución de los hongos. "Esto nos da una idea de las diferencias en estas especies realmente relacionadas", dijo. "Cuando diseñamosorganismos, estamos haciendo cambios. Entonces, ¿hay ideas que podamos obtener del proceso de evolución natural para ayudarnos a diseñar mejores cepas que puedan hacer cosas buenas por nosotros? "
Al elegir centrarse en la sección Nigri, los investigadores reconocieron la gran cantidad de aplicaciones industriales para los hongos dentro de este subgrupo. Sirven como organismos de producción para 49 de 260 enzimas industriales y también son productores muy eficientes de enzimas y metabolitos secundarios. JGI FungalEl jefe del programa, Igor Grigoriev, dijo que uno de los objetivos en la secuenciación de los genomas dentro del Aspergillus el género es aumentar el catálogo de enzimas activas de carbohidratos CAzimas, que pueden degradar las paredes celulares de las plantas y, por lo tanto, tener aplicaciones en la misión del DOE para desarrollar procesos industriales para producir combustibles alternativos sostenibles utilizando cultivos de materia prima de bioenergía candidatos.
Miles de nuevos genes
El equipo descubrió miles de genes nuevos. Para todos los conjuntos de genes exclusivos de la sección Nigri, identificaron grupos de genes específicos de la especie que están relacionados con funciones como el metabolismo secundario, la regulación de genes o la regulación de proteínas. Además, aunque hay genes compartidosgrupos para la biosíntesis de metabolitos secundarios, todos los Aspergillus la sección de hongos Nigri tiene sus propios conjuntos únicos de genes para el metabolismo secundario.
Andersen señaló que a medida que el equipo continúa secuenciando y anotando más genomas dentro del Aspergillus género, su objetivo es informar sobre más secciones. "Muchos descubrimientos más interesantes están en camino; la diversidad es enorme y el potencial de bioenergía, biotecnología y bioterapéutica en todas y cada una de las especies es asombroso".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por DOE / Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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