Los investigadores han desarrollado un nuevo método de detección de alto rendimiento para detectar interacciones directas de biomoléculas. Estas técnicas de detección son necesarias para revelar cómo se conectan los bloques de construcción celular, lo cual es crucial para comprender cómo funcionan o disfuncionan las células en el caso de enfermedades. El métodofue diseñado para ser económico y factible, haciéndolo accesible para todos los laboratorios de investigación biomédica estándar.
Las proteínas son los componentes básicos de la célula. Hacen la mayor parte del trabajo y son esenciales para la estructura, función y regulación dinámica de la célula y los tejidos y órganos del cuerpo. Las proteínas rara vez funcionan solas, interactúan, forman complejos de proteínas o se unenADN y ARN para controlar lo que hace una célula. Estos complejos son piezas clave de muchas reacciones importantes dentro de la célula, como el metabolismo energético o la regulación genética. Cualquier cambio en esas interacciones, que puede ser causado, por ejemplo, por una mutación, puede hacer quediferencia entre salud y enfermedad. Por lo tanto, para comprender cómo funcionan las células, o qué podría salir mal en las células enfermas, es esencial saber cómo interactúan sus componentes básicos.
Las nuevas tecnologías permitieron a los científicos durante las últimas décadas comprender la información genética que posee un organismo, cuál de esta información se utiliza activamente y qué proteínas produce la célula en diferentes circunstancias. Ahora es un gran desafío comprender cómo biomoléculas comoLas proteínas y las moléculas mensajeras de ARN se combinan para formar los complejos necesarios para una célula funcional. En otras palabras, sabemos las diez mil partes de las que se construye una célula, pero no sabemos cómo deben estar juntas.
en un artículo publicado en Comunicaciones de la naturaleza , los científicos del Centro de Regulación Genómica CRG describen el desarrollo de un nuevo método, llamado "rec-YnH", que fue diseñado para comprender los complejos formados entre cientos de proteínas y ARN al mismo tiempo.
El método, cuyo desarrollo fue liderado por Sebastián Maurer en colaboración con el laboratorio Luis Serrano, es la primera técnica que permite la detección de interacciones entre un gran número de proteínas y moléculas de ARN al mismo tiempo. Los investigadores ponen énfasis en ladesarrollo de un método factible y asequible que sea de amplia aplicación.
"Nuestro método mide de manera confiable las interacciones entre muchas proteínas o muchas proteínas y fragmentos de ARN sin la necesidad de equipos especializados y costosos", explica Sebastian Maurer. "Esta metodología puede ser utilizada por cualquier laboratorio de investigación biomédica estándar y será útil para estudiar unproceso particular en la célula, sino también para los investigadores que tienen que explorar millones de interacciones de proteínas a la vez para buscar un complejo involucrado en una enfermedad en particular ", concluye.
Dos laboratorios de CRG combinaron con éxito su experiencia en bioinformática, bioquímica y biología molecular para implementar y validar el método. "Nuestra colaboración resultó en un método asequible y factible que produce mapas de alta calidad de interacciones proteína-proteína y proteína-ARN".dice Jae-Seong Yang, investigador postdoctoral y co-primer autor del artículo.
"Las interacciones entre proteínas y ARN son clave para muchos procesos biológicos, incluida la regulación de genes, y nuestro método es el primero que puede detectar interacciones entre cientos de proteínas y ARN al mismo tiempo. Tener una nueva herramienta tan eficiente a mano será extremadamenteútil para responder preguntas importantes relacionadas con muchas enfermedades ", afirma la coautora principal del estudio e investigadora del CRG, Mireia Garriga.
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Materiales proporcionado por Centro de Regulación Genómica . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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