Las primeras cepas de Salmonella tifimurio , un patógeno responsable de millones de infecciones del torrente sanguíneo al año en el África subsahariana, se ha identificado en la República Democrática del Congo RDC. La farmacorresistencia ha aumentado en grupos sucesivos de S. tifimurio con el tiempo. Estas nuevas cepas son resistentes a todos menos uno de los medicamentos comúnmente disponibles en la República Democrática del Congo, y una muestra muestra una susceptibilidad reducida a este antibiótico final.
El estudio, publicado hoy 19 de septiembre de 2019 en Comunicaciones de la naturaleza , fue realizada por investigadores del Instituto de Medicina Tropical ITM en Amberes, el Institut National de Recherche Biomédicale INRB en la República Democrática del Congo, el Instituto Wellcome Sanger, la Universidad de Cambridge y sus colaboradores. Los hallazgos sugieren que S. tifimurio ha evolucionado en el África subsahariana en las últimas décadas y continúa haciéndolo. Se necesitará un enfoque multifacético para rastrear y controlar la propagación de XDR Salmonella , incluida una mayor vigilancia microbiológica y genómica.
la mayoría Salmonella las infecciones provocan síntomas asociados con la intoxicación alimentaria. Si bien son desagradables, los síntomas no ponen en peligro la vida en la gran mayoría de los casos. Pero en el África subsahariana Salmonella como S. el tifimurio puede causar infecciones de la sangre, conocidas como invasivas no tifoideas Salmonella iNTS infecciones.
Se estima que cada año, las infecciones iNTS afectan a 3,4 millones de personas y provocan 681,316 muertes en todo el mundo, de las cuales la mayoría son causadas por S. tifimurio . La contención y el tratamiento de las infecciones iNTS en lugares como la República Democrática del Congo se complica por el acceso limitado a la atención médica, los desafíos de infraestructura y la inmunidad debilitada, con niños menores de cinco años particularmente en riesgo.
Se sabe que las infecciones por iNTS en África subsahariana están dominadas por un tipo de S. tifimurio conocido como ST313, que está asociado con la resistencia a los antibióticos. Dos grupos de ST313 denominados linaje I y II se separaron de forma independiente y posteriormente se extendieron por el continente africano. La resistencia a los antibióticos ha ido creciendo con el tiempo, y el linaje II es ahora la causa principalde infecciones iNTS.
Ahora una asociación de investigación global está trabajando para comprender cómo Salmonella ST313 continúa evolucionando y desarrollando resistencia a los medicamentos. Trabajando con muestras de sangre recolectadas en hospitales de la República Democrática del Congo de personas con sospechas de infecciones del torrente sanguíneo, los investigadores de INRB e ITM observaron niveles de resistencia a los antibióticos nunca antes vistos en S. tifimurio que causa infecciones del torrente sanguíneo, incluida la resistencia al antibiótico azitromicina, un medicamento que normalmente se mantiene en reserva en caso de que otros resulten ineficaces.
Para comprender mejor estos hallazgos, se secuenciaron y analizaron el genoma de estas cepas, incluidos análisis bioinformáticos y experimentos de laboratorio en ITM y el Instituto Wellcome Sanger, y análisis de aprendizaje automático en el Centro de Vigilancia de Patógenos Genómicos CGPS. Análisis de estos S. tifimurio los genomas identificaron un nuevo subgrupo que se está ramificando de ST313, llamado linaje II.1. Se estima que surgió en 2004, este nuevo grupo exhibe una extensa resistencia a los medicamentos XDR.
La Dra.Sandra Van Puyvelde, primera autora del estudio del Instituto de Medicina Tropical y científica visitante del Instituto Wellcome Sanger, dijo: "Todos los genes de resistencia a los antibióticos que contribuyen a 'XDR' están presentes en el mismo plásmido. Esto es preocupante porqueun plásmido es un elemento genético móvil que podría transferirse a otras bacterias. Mientras acumulaba más resistencia a los antibióticos, descubrimos que la novela Salmonella tifimurio la línea también muestra más cambios genéticos y de comportamiento que sugieren una evolución continua de la bacteria hacia infecciones del torrente sanguíneo ".
Los investigadores también estudiaron la forma S. tifimurio se está adaptando a un 'estilo de vida' invasivo, alejándose de las formas de Salmonella que causan enfermedades gastrointestinales hacia los tipos que causan peligrosas infecciones invasivas del torrente sanguíneo en el África subsahariana. Además de los experimentos de laboratorio, las muestras se analizaron con un algoritmo de aprendizaje automático diseñado para buscar patrones característicos en el ADN de Salmonella que indican el potencial de causar infecciones invasivas peligrosas.
La Dra. Nicole Wheeler, bioinformática del Centro de Vigilancia de Patógenos Genómicos, con sede en el Instituto Wellcome Sanger, dijo: "En el laboratorio hemos observado cambios en este nuevo grupo de Salmonella tifimurio que hemos visto en otras salmonelas invasoras. Lo interesante como bioinformático es que hemos podido detectar estos cambios mediante el aprendizaje automático. La esperanza es que en un futuro cercano podamos implementar el aprendizaje automáticoen un papel más predictivo para ayudar a controlar la aparición y propagación de cepas de bacterias resistentes a los medicamentos como S. tifimurio . "
INRB e ITM han establecido la vigilancia de las infecciones del torrente sanguíneo en los últimos diez años, lo que ha sido fundamental en la detección temprana del XDR S. tifimurio .
El profesor Octavie Lunguya de INRB en la República Democrática del Congo, dijo: "Aislamos el Salmonella tifimurio de pacientes en hospitales de la República Democrática del Congo durante nuestras actividades de vigilancia de infecciones del torrente sanguíneo. Ahora es crucial que controlemos de cerca las bacterias y su progresión ".
El profesor Gordon Dougan, de la Universidad de Cambridge, dijo: "Estudios como este son únicos, ya que estamos haciendo el puente entre los problemas de salud más importantes que se observan en los hospitales de todo el mundo con una investigación biológica en profundidad para la que aplicamos tecnologías de vanguardiatecnologías. Colaboraciones como esta son clave y serán importantes en el futuro para obtener más conocimientos sobre las enfermedades emergentes ".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionados por Instituto Wellcome Trust Sanger . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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