Un grupo internacional liderado por investigadores del Centro RIKEN de Ciencias Médicas Integrativas ha utilizado una combinación de análisis de asociación de todo el genoma, o GWAS, y una comparación de traspasos de diferentes estudios de GWAS, para obtener un análisis más precisopredictor de enfermedad arterial coronaria basado en factores genéticos.
Se sabe que la enfermedad de las arterias coronarias, la principal causa de muerte en el mundo, es altamente hereditaria y, en algunos casos, sobre todo en el gen PCSK9, el conocimiento de las asociaciones genéticas ha contribuido al desarrollo de terapias. Puntuaciones de riesgo genéticobasado en información genética puede predecir con precisión la aparición de enfermedades en individuos. Sin embargo, los estudios hasta ahora se han centrado principalmente en poblaciones europeas, y no está claro si los resultados se aplican a otras poblaciones ancestrales.
En el presente estudio, publicado en Genética de la naturaleza , el equipo realizó dos tareas importantes. Primero, analizaron la genética de la enfermedad en una población japonesa, comparando las secuencias del genoma de 25.892 pacientes con enfermedad de las arterias coronarias en el Biobanco de Japón y 142.336 controles, lo que constituye el proyecto GWAS más grande enenfermedad de las arterias coronarias en una población no europea. Utilizando un panel de referencia que desarrollaron para estimar los genotipos de los individuos, identificaron 48 loci genéticos asociados con una susceptibilidad a la enfermedad de las arterias coronarias, ocho de los cuales eran desconocidos previamente. En particular, encontraronuna variante genética en el gen RNF213, que se sabe que está asociado con una enfermedad cerebrovascular conocida como enfermedad de moyamoya, que nunca se había identificado en estudios de GWAS con cohortes europeas.
Gracias a estos resultados, pudieron construir un panel de referencia para la población japonesa, que podría usarse para medir el riesgo de incluso variantes encontradas en un porcentaje muy pequeño de la población ". Encontramos una variante en el gen LDLR", dice Kaoru Ito, uno de los autores del estudio," que no es muy común, pero tiene un efecto importante sobre el metabolismo del colesterol, y los japoneses con esta rara mutación aumenta cinco veces la probabilidad de desarrollar enfermedad de las arterias coronarias."El grupo también descubrió mutaciones específicas de la población japonesa que pueden reducir el sustento de la enfermedad de las arterias coronarias. El siguiente paso del grupo fue combinar los resultados de los 170.000 sujetos japoneses con otros dos conjuntos de datos de poblaciones europeas aproximadamente 180.000 del estudio CARDIoGRAMplusC4D y300.000 del Biobanco del Reino Unido, para crear uno de los GWAS transétnicos más grandes del mundo en la enfermedad de las arterias coronarias con un total de más de 600.000 personas.Se identificaron 35 nuevos loci asociados con la enfermedad, y uno de ellos estaba en el gen HMGCR, que es el objetivo de las estatinas.
Un resultado muy positivo del estudio fue que el grupo pudo usar los GWA combinados para crear una puntuación de riesgo genético que superó los resultados de las GSC elaboradas según Ito, "Esto es emocionante, ya que significa que incluso cuandoHay diferentes frecuencias de variantes en diferentes poblaciones, podemos combinar estudios de GWAS de diferentes ascendencias y usar esto para crear una puntuación de riesgo que sea más precisa que cualquiera de las individuales, y esto significa que la integración de datos existentes es una buena manera de desarrollar GRSen poblaciones no europeas ". Continúa:" Esperamos que nuestro estudio ayude a conducir al desarrollo de GRS optimizados para los japoneses, que podrían usarse de manera efectiva en el futuro de la medicina de precisión basada en información genética ".
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Materiales proporcionado por RIKEN . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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