Los científicos de la Universidad de Southampton piensan que la secuenciación de próxima generación NGS, por sus siglas en inglés de organismos invasivos es la clave para avanzar en nuestra comprensión de los procesos ecológicos y evolutivos.
En una revisión de estudios recientes publicados en Zoología actual , los investigadores dicen que la técnica está subutilizada en el campo de la biología de la invasión. Creen que NGS tiene el potencial de transformar nuestra comprensión de por qué las especies no nativas se adaptan y prosperan en nuevos entornos, a menudo a expensas de sus competidores indígenas.
La clave del éxito de las invasiones biológicas puede estar en el genoma el código de ADN completo de un organismo y el transcriptoma los genes específicos que se están expresando. Mientras que el genoma de un individuo está más o menos fijado alterando solo a través demutación, el transcriptoma puede variar según el entorno.
"Las especies introducidas se adaptan a su nuevo entorno mientras hablamos, por lo que en lugar de tomar cientos de miles de años para evolucionar, podemos presenciar cómo las especies se adaptan en tiempo real", dice el Dr. Marc Rius, profesor de la Universidad de Southampton.
El coautor Dr. Mark Chapman, quien también es profesor en la Universidad de Southampton, dice: "Al comparar y contrastar una población indígena con una introducida, la genómica le permite separar qué rasgos genéticos se deben a la selección natural y cuálesse deben a la evolución neutral, que ocurre de forma habitual "
La producción de NGS es de 100 a 100,000 veces mayor que la secuenciación de primera generación o Sanger, y tiene varias otras ventajas. Por ejemplo, NGS hace que la secuenciación sin un genoma completo o transcriptoma de referencia sea mucho más rentable y fácil de hacer,lo que ha llevado a que se secuenciaran muchos más organismos 'no modelo'.
"En comparación con los métodos anteriores, NGS es una opción mucho más rentable para secuenciar grandes porciones del genoma", dice el coautor Harry Hornsby, investigador de posgrado en Southampton. "Nos permite comparar genomas completos y transcriptomos,dándonos una imagen mucho más amplia y detallada de lo que está sucediendo a nivel genético entre individuos y poblaciones, revelando patrones de selección y los genes que podrían apuntalar la adaptación ".
La revisión muestra que a medida que el costo de NGS ha disminuido constantemente desde su inicio a mediados de la década de 2000, el número de publicaciones que investigan la genética de la invasión ha aumentado, allanando el camino para una revolución de NGS en el campo. A pesar de esto,relativamente pocos estudios han utilizado la técnica y gran parte del trabajo que tiene es descriptivo, en lugar de análisis exhaustivos.
Steve Bourne, quien también fue coautor del estudio, comenta: "Lo que hemos visto es que se pueden obtener algunas ideas realmente interesantes cuando se aplica NGS a la biología de la invasión. Tiene un enorme potencial para acelerar nuestra comprensión y ayudarnosdescubra qué hace que una especie invasora tenga éxito y, en términos más generales, cómo se adaptan las especies a los nuevos entornos. Sin embargo, hay una brecha que salvar antes de que se convierta en una práctica común ".
Además de ofrecer una visión del proceso evolutivo, los hallazgos podrían tener aplicaciones prácticas para el manejo de los ecosistemas y la detección y control de especies invasoras que pueden afectar negativamente la biodiversidad. Por ejemplo, cuando los sapos de caña llegaron a Australia, su defensael mecanismo demostró ser tan tóxico que agotó las poblaciones de depredadores nativos, que murieron por comerlos.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Southampton . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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