La Universidad Politécnica de Hong Kong PolyU ha logrado un gran avance en la genómica del cáncer mediante el desarrollo de una nueva plataforma de análisis de grandes datos para analizar las interacciones entre genes. La plataforma de análisis revela los patrones no regulados de la red de genes en el cáncer y descubre posibles diagnósticos yLos genes objetivo terapéuticos, la nucleofosmina NPM1 y sus genes asociados, en la leucemia mielógena crónica LMC. Estos descubrimientos ayudan al desarrollo futuro de la estrategia de tratamiento orientada a NPM1 en la LMC y permiten que la terapia dirigida sea más específica. La plataforma de análisis también puede serEl avance fue realizado por un equipo de investigación dirigido por el profesor Benjamin Yung, que está compuesto por científicos biomédicos, el Dr. Lawrence Chan y el Dr. Cesar Wong del Departamento de Tecnología e Informática de la Salud HTI en PolyU ybioestadísticos de la Universidad de Harvard.
La forma tradicional de identificar marcadores genéticos del cáncer es examinar los genes en todo el genoma humano uno por uno con respecto a sus diferencias de expresión individuales entre pacientes con cáncer y personas sanas. Tal método arraigado no puede proporcionar ninguna información sobre las interacciones entregenes y sus cambios sistémicos que componen el complicado mecanismo del cáncer.
El equipo de investigación planteó la hipótesis de que los genes que participan en el mismo mecanismo están coexpresados es decir, los niveles de expresión de los pares de genes están correlacionados y exploraron las correlaciones de par a par entre los genes para descifrar el mecanismo subyacente al cáncer.de los pares de genes aumentan geométricamente con el número de genes de interés. Como el genoma humano tiene más de 20,000 genes codificadores de proteínas, el análisis de coexpresión podría involucrar alrededor de 0.2 mil millones de posibles pares de genes. Además, la prueba estadística para el análisis de coexpresióntiene que ser refinado para mantener la confiabilidad de los resultados de la detección Los expertos en bioestadística de la Universidad de Harvard ayudaron al equipo a realizar una simulación por computadora a gran escala para establecer el método estadístico para analizar la diferencia específica de cáncer en la expresión conjunta. El equipo superó los desafíos en el procesamientodatos masivos, y logró un rendimiento de analizar 0.2 mil millones de pares de genes en dos días, una misión imposible para el tradicionalcapacho.El equipo ha construido una base científica sin precedentes para el análisis de la coexpresión, allanando el camino hacia el futuro de la medicina traslacional.
Este estudio ha asegurado una nueva plataforma de análisis de red de coexpresión estructural, que revela la patogénesis del cáncer y su posible estrategia de tratamiento orientada a NPM1. El análisis de coexpresión descubre nuevos patrones no regulados de red de genes para comprender la biología del cáncer, identificando nuevos objetivos para el tratamientoy todas estas innovaciones contribuyen a una gran ciencia. Esta plataforma se puede aplicar fácilmente a otras enfermedades para investigación diagnóstica, pronóstica y terapéutica. Este hallazgo se publicará en breve en Informes científicos de los editores de Naturaleza , mostrando el éxito de la investigación científica como resultado de la colaboración interdisciplinaria.
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Materiales proporcionados por La Universidad Politécnica de Hong Kong . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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