Investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington en St. Louis han desarrollado una prueba de diagnóstico para detectar rápidamente el enterovirus D68 EV-D68, un virus respiratorio que causó una enfermedad inusualmente grave en niños el año pasado. El brote causó infecciones a una tasa sin precedentes, con más de 1,000 casos confirmados y 14 muertes reportadas en todo el país, según los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades CDC.
Resultados publicados en línea en El Diario de Microbiología Clínica demuestre que la prueba es extremadamente efectiva para identificar varias cepas de EV-D68 y reduce la cantidad de tiempo necesaria para detectar el virus.
Los procedimientos anteriores para identificar cepas de enterovirus implicaban la secuenciación de una región del genoma del virus, que es demasiado engorrosa para realizar en un gran número de pacientes. La nueva prueba se puede completar en unas pocas horas, mientras que las técnicas anteriores tardaron varios días en procesarse.Los investigadores también dijeron que la nueva prueba es más específica que las pruebas de diagnóstico disponibles para el enterovirus.
"Las pruebas comerciales para infecciones virales respiratorias generalmente no distinguen entre los rinovirus, que causan el resfriado común, y los enterovirus, y dentro de cada uno de esos grupos hay muchos tipos diferentes", dijo el autor principal Gregory A. Storch, MD, elRuth L. Siteman Profesora de Pediatría.
"Tener una herramienta para identificar qué casos de enfermedades respiratorias son realmente EV-D68 es una ventaja para la salud pública", agregó. "Este tipo de pruebas ayudan a las decisiones de tratamiento porque es importante saber que el paciente no tieneinfluenza u otra enfermedad que podría requerir un tratamiento específico. También es importante en un hospital para prevenir infecciones porque los médicos toman pacientes con un virus en particular y los mantienen separados de los pacientes infectados con otros agentes infecciosos ".
Dado que se publican detalles de la técnica de la prueba, otros laboratorios pueden usarla como plantilla para crear sus propias pruebas en caso de otro brote.
Los rinovirus y los enterovirus son causas comunes de enfermedades respiratorias. Los médicos a menudo no evalúan a los pacientes para detectar infecciones sospechosas con ninguno de los virus, especialmente cuando sus enfermedades son leves. Pero después del brote mortal de la cepa D68 del año pasado, un equipo de investigadores dirigido por Storchy Todd N. Wylie, instructor en pediatría, comenzaron a trabajar para desarrollar una prueba que podría apuntar a EV-D68.
Hay una serie de variantes del enterovirus D68 que están estrechamente relacionadas genéticamente. Pero ligeras variaciones en sus genomas complican la capacidad de los investigadores para detectar todas las variantes con una prueba. Debido a esta variación, las pruebas EV-D68 anteriores omitirán algunas de lasVariantes EV-D68.
Los investigadores aislaron pequeños segmentos de secuencias de ADN virales que son comunes a todos los subtipos de D68 pero no a otros virus. Wylie desarrolló un programa informático que permite comparar grandes cantidades de secuencias de ADN simultáneamente. Ningún otro laboratorio había utilizado previamente bases de datos públicas en estemanera de recopilar las secuencias de nucleótidos de cada variante de D68 disponible y compararlas con las secuencias de todos los demás virus para los que hay datos de secuencia disponibles. La técnica de Wylie hizo posible crear una prueba que identifica todos los subtipos conocidos de enterovirus D68 y excluye todos los demásvirus conocidos
La nueva prueba es más efectiva que otras para EV-D68, incluida una desarrollada por los CDC en octubre que se implementó rápidamente en respuesta a la crisis de salud pública. Para evaluar la nueva prueba, los investigadores examinaron paneles conocidos de rinovirus y enterovirusDe los virus que observaron, la nueva prueba no perdió ninguna muestra conocida de EV-D68, y no identificó falsamente EV-D68 en muestras que se sabía que eran otros virus. La prueba mantuvo su precisión incluso con pequeñas cantidadesdel virus.
"Hay una variedad de virus D68, y nuestro ensayo fue diseñado para detectarlos a todos", dijo Storch. "Recibimos muchas muestras de enterovirus de otros hospitales y realizamos la prueba a ciegas en todos ellos. En los virus que observamosen, la prueba funcionó el 100 por ciento del tiempo. Solo detectó cepas de EV-D68 y las detectó a todas; la prueba no detectó ninguno de los otros enterovirus o rinovirus ".
Los investigadores describieron algunas posibles limitaciones de la nueva prueba. Hay muchos virus con secuencias que no están disponibles y no se pudieron considerar al diseñar la prueba. Además, los investigadores dijeron que EV-D68 podría mutar en el futuro, por lo queque el ensayo podría fallar al detectarlo
La nueva prueba fue posible gracias al trabajo anterior de Kristine M. Wylie, PhD, profesora asistente de pediatría y colegas en el Departamento de Pediatría y en el Instituto de Genoma McDonnell de la universidad, que secuenciaron el genoma del EV-D68 que circulaba enSt. Louis el año pasado. Un área de investigación futura es investigar si la técnica de Wylie puede servir como plantilla para crear más pruebas para otros virus cuyos genomas han sido secuenciados.
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Materiales proporcionado por Facultad de medicina de la Universidad de Washington . Original escrito por Alex Griffel y Julia Evangelou Strait. Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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