Barcelona participa en el proyecto de investigación internacional Metasub, cuyo objetivo es mapear el microbioma de los sistemas de transporte público en 54 ciudades de todo el mundo, incluidas Nueva York, Hong Kong, París o Sydney.
Los científicos del Centro de Regulación Genómica CRG están contribuyendo a este proyecto proporcionando, procesando y secuenciando muestras del metro de Barcelona y también liderando el grupo de trabajo de procesamiento de muestras. Estandarizaron y mejoraron los protocolos de secuenciación y procesamiento de muestras paratodos los laboratorios que participan en este proyecto.
Los científicos del Centro de Regulación Genómica CRG en Barcelona, España, se han unido hoy al Día Mundial de Muestreo de la Ciudad para el proyecto de investigación MetaSub. Comenzó en 2013 en Nueva York y fue dirigido por el Dr. Christopher E Mason en Weill Cornell Medicine,MetaSub es un consorcio internacional de laboratorios para establecer un "mapa de ADN" mundial de microbiomas en sistemas de transporte público.
"Reunir a científicos en docenas de ciudades de todo el mundo en una verdadera iniciativa interdisciplinaria hace que este proyecto sea único. No solo podremos mapear el microbioma del metro urbano sino también desarrollar nuevos estándares para el campo de la metagenómica y optimizar los métodos para todos los pasosdentro de este proyecto: desde la recolección de muestras hasta la visualización de datos a través del aislamiento y secuenciación de ADN / ARN ", explica Stephan Ossowski, líder del grupo en el Centro de Regulación Genómica. La iniciativa MetaSub es pionera en un estudio sin precedentes de los sistemas de transporte público urbano y las ciudades alrededor delmundo.
"Consideramos que la colaboración con las instituciones de investigación es imprescindible. Gracias al proyecto Metasub profundizaremos nuestro conocimiento sobre el microbioma del metro, lo que contribuirá a mejorar el viaje de miles de personas en la red de metro de Barcelona", afirma Eladio de Miguel, director de calidad y medio ambiente en Transports Metropolitans de Barcelona TMB.
El metro: un "ecosistema" único
Los sistemas de transporte público representan biomas, microbiomas y metagenomas urbanos únicos. Estas estructuras subterráneas y elevadas son ubicuas y las interacciones entre los pasajeros y las superficies del metro definen quizás uno de los entornos construidos más grandes, de alto tráfico y universales del mundo.Además, estas superficies de metro definen el viaje diario para decenas de millones de personas todos los días y miles de millones de personas cada año.
El microbioma constituye un elemento importante de nuestro entorno: las células bacterianas en y sobre nuestros cuerpos superan en número a las células humanas en una proporción de 10: 1, contribuyen hasta el 36% de las moléculas activas presentes en el torrente sanguíneo humano y sirven como clavemediador de la salud humana. Sin embargo, la forma en que los humanos pueden interactuar o adquirir nuevas especies de bacterias depende del entorno al que están expuestos, los tipos de superficies que tocan y la dinámica física de su entorno. Esto es especialmente cierto en densos, entornos construidos, como ciudades, en los que actualmente vive la mayoría de la población mundial 54%.
Vinculación de genómica, salud pública y ciudades inteligentes
Los datos producidos por el consorcio beneficiarán a los planificadores de la ciudad, a los funcionarios de salud pública y a los diseñadores, así como al descubrimiento de nuevas especies, sistemas biológicos y grupos de genes biosintéticos BGC, permitiendo así una era de respuesta más cuantificada,y "ciudades más inteligentes"
Hoy los científicos se unieron al Día Mundial de Muestreo de la Ciudad, pero las muestras se recolectarán periódicamente en Barcelona, y en el resto de las ciudades, durante un período de cinco años. Muchas preguntas nuevas surgen de este proyecto, por ejemplo, cómo cambia el microbiomade acuerdo con el clima, el flujo de personas, la limpieza de la estación o los materiales de sus muebles.También, preguntas relacionadas con la ciudad, como el vecindario en el que se encuentra la estación, el nivel socioeconómico de sus ciudadanos,etc.
Para tener datos representativos, los científicos de CRG junto con el departamento de medio ambiente de TMB han seleccionado un conjunto de estaciones que incluyen, por ejemplo, algunas de las estaciones más antiguas de la ciudad, las más turísticas o las cercanas a hospitalesTambién seleccionaron estaciones en diferentes vecindarios que ilustran la diversidad y el multiculturalismo en la ciudad.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Centro de Regulación Genómica . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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