La información incrustada en el ADN ha contribuido durante mucho tiempo a la conservación de la biodiversidad, ayudando a reconstruir la historia pasada de las especies, evaluar su estado actual y guiar estrategias para su protección. Un nuevo estudio muestra que todo el genoma de especies difíciles de estudiar ahora puede serdisponible para los científicos sin la necesidad de manejar o incluso ver su organismo de estudio, lo que abre el campo de la genómica de la conservación al uso de técnicas de muestreo no invasivas.
Las especies en peligro de extinción y elusivas, por definición, pueden ser raras y difíciles de localizar. Como resultado, los genetistas de conservación generalmente tienen que depender de fuentes de ADN recolectadas de manera no invasiva, como cabello, plumas o heces. Hasta ahora, estaslos enfoques han tenido bastante éxito en la obtención de información genética de un puñado de marcadores en todo el genoma. Sin embargo, la llamada 'secuenciación de ADN de próxima generación' NGS ahora permite a los investigadores recopilar volúmenes masivos de datos genéticos en la escala de genomas completos,Sin embargo, los requisitos necesarios para aprovechar dicha tecnología pueden no estar disponibles en la mayoría de los casos para especies en peligro de extinción. Por ejemplo, NGS generalmente requiere alta calidad y grandes cantidades de ADN inicial extraído de tejidos frescos o sangre. La adquisición de dichos materiales es trivial para los humanos;Por lo general, el hisopo de la mejilla funcionará. Este no es el caso, por ejemplo, del leopardo de Amur, que es tanto raro como esquivo. En tales casos, los científicos y los gerentes deben confiar de manera no invasivafuentes recolectadas de ADN que generalmente producen baja calidad y baja cantidad de material de partida.
El nuevo estudio publicado en la revista de acceso abierto PeerJ por investigadores de la Universidad de Columbia Británica UBC y SNPsaurus LLC demuestra que el muestreo no invasivo que es esencial para muchos estudios relacionados con la conservación ahora es compatible con los requisitos mínimos para aprovechar las tecnologías NGS. Como resultado, lo haráahora será posible ampliar aún más el campo de la genética de la conservación en la era de la genómica.
"Pudimos recopilar datos de todo el genoma de poblaciones naturales de la pika americana evasiva y sensible al clima en una escala sin precedentes hace unos años", dice el Dr. Michael Russello, profesor asociado de la UBC e investigador principal deEl innovador enfoque de recopilación de datos promovido por el Dr. Eric Johnson y el Dr. Paul Etter de SNPsaurus LLC, ambos coautores del estudio, permitió el muestreo de casi 10,000 sitios variables en el genoma del pika estadounidense utilizando, en algunos casos,tan poco como 1 nanogramo una milmillonésima parte de un gramo de ADN inicial extraído del cabello ". Hay enormes beneficios para ampliar nuestra cobertura del genoma cuando se estudian especies de interés para la conservación, ya que mejora enormemente nuestras inferencias de las características genéticas clave de las poblacionesy abre nuevas vías de investigación en forma de identificación potencial de aquellas partes del genoma que están involucradas en la capacidad de los organismos para adaptarse a entornos cambiantes ", agrega el Dr. Russello. El uso de NGS en muestras recolectadas de forma no invasiva no está exenta de desafíos, pero puede superarse con una serie de consideraciones cuidadosas señaladas por los autores.
En una era en la que la biodiversidad global continúa disminuyendo a tasas consistentes con una extinción masiva, los científicos y gerentes de conservación ahora pueden agregar genómica a su conjunto de herramientas para intentar documentar y revertir esta tendencia.
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Materiales proporcionados por PeerJ . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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