Globalmente, la biodiversidad se concentra alrededor del ecuador, pero las instituciones científicas que generan datos de secuencia de ADN para estudiar que la biodiversidad tiende a agruparse en los países desarrollados hacia los polos. Sin embargo, el costo rápidamente decreciente de la secuenciación de ADN tiene el potencial de cambiar esta dinámicay crear una distribución global más equitativa de la investigación genética. En una investigación publicada en un número reciente de Aplicaciones en Ciencias de las plantas , la Dra. Gillian Dean y sus colegas muestran la viabilidad de producir datos de secuencia de alta calidad en un laboratorio en Indonesia.
Para muchos laboratorios en el mundo en desarrollo, la falta de fondos y experiencia práctica son obstáculos importantes para generar sus propios datos de secuencia de ADN. Sin embargo, la carga financiera, técnica y logística de producir datos de secuencia de ADN ha caído precipitadamente en los últimos años.La secuenciación de ADN se realiza cada vez más en instalaciones "centrales" centralizadas dedicadas a producir datos de secuencia de alta calidad a partir de muestras preparadas a alto volumen y bajo costo. Esto significa que los laboratorios solo necesitan hacer un procesamiento inicial de tejido para preparar muestras de ADN para enviarlas a una secuenciacióninstalación central.
Las técnicas moleculares como la extracción de ADN, la purificación y la PCR, necesarias para preparar las muestras para la secuenciación, ahora están bastante bien establecidas, con protocolos que son relativamente simples usando reactivos ingredientes bastante económicos ". Puede parecer desalentador configurar un molecularlaboratorio de biología, pero a medida que los métodos se vuelven más baratos y robustos, realmente está al alcance de más y más investigadores ", explica el Dr. Gillian Dean, autor principal del estudio." Queremos compartir nuestra experiencia para ayudar a las personas a establecer estosmétodos, y aprovechar al máximo el tipo de datos que se pueden generar ". En consecuencia, el Dr. Dean y sus colegas compararon métodos para generar datos de secuencia de ADN en el Laboratorio de Sistemática Molecular en el Herbario Bogoriense, Centro de Investigación de Biología, Instituto de Ciencias de Indonesia.LIPI, en Cibinong, Java Occidental, Indonesia. Los datos del código de barras de ADN generados en este estudio piloto formaron parte de un proyecto para crear una flora digital de acceso abierto del Parque Nacional Gunung Palung en West Kalimantan, Indonesia.
Ayudar a los laboratorios en los países en desarrollo a establecer la capacidad de producir datos de secuencia de ADN amplía el número de contribuyentes a las bases de datos de secuencia de ADN, lo cual es bueno para la ciencia en general y puede ser útil para cualquier número de análisis bioinformáticos. Según el Dr. Dean, "La comunidad científica más amplia se beneficia al tener más capacidad en términos de personas que producen datos ". Pero también fortalece las instituciones científicas en el mundo en desarrollo, ampliando los tipos de estudios que los científicos pueden realizar y las preguntas que pueden responder.
"La capacidad de preparar el ADN de interés para la secuencia significa que los científicos en los países en desarrollo tienen más autonomía a la hora de diseñar proyectos, elegir exactamente los datos que generan y con qué propósito", explica el Dr. Dean ".también permite a esos científicos tener el mismo acceso y control sobre los datos resultantes ". Además de los beneficios científicos, existe una justificación legal para expandir la capacidad de generar datos de secuencia de ADN en más países, ya que muchos países con biodiversidad han promulgado leyes que restringen el accesoal muestreo para estudios realizados fuera de sus fronteras.
El Dr. Dean también enfatiza la dimensión ética de expandir la capacidad de los laboratorios moleculares en los países en desarrollo, lo que ayuda a crear un establecimiento científico global más equitativo y abordar el legado del colonialismo. "Creo que el punto principal es que debemos sermás inclusivo de científicos de países donde se originan las muestras. Históricamente, investigadores de países más desarrollados han llegado y llevado muestras a su país de origen, y en muchos casos no han compartido los datos resultantes con el país de origen ", dice el Dr. Dean."Debemos alejarnos de esto y comenzar a tener un enfoque equitativo para hacer investigación en los países menos desarrollados". Este estudio representa un paso en ese largo viaje.
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Materiales proporcionados por Sociedad Botánica de América . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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