Una plataforma de análisis de datos, la primera de su tipo, permite a los investigadores seleccionar la mejor herramienta para interpretar las cantidades abrumadoras de datos generados por la investigación unicelular. Darle sentido a esta información con precisión ayudará a explicar los roles vitales y variadoslas células juegan en la salud y la enfermedad. La plataforma, CellBench, fue publicada en Métodos de la naturaleza .
La plataforma de acceso libre, que incluye software y varios conjuntos de datos estándar de oro, permite comparar el rendimiento de miles de diferentes opciones de análisis unicelulares para ayudar a los investigadores a identificar el mejor método para las preguntas que desean responder.
El proyecto fue dirigido por el Profesor Asociado Matthew Ritchie y el Sr. Luyi Tian del Instituto de Investigación Médica Walter y Eliza Hall, junto con el Dr. Kim-Anh Lê Cao y el Sr. Al J Abadi de la Universidad de Melbourne.
Todavía se desconoce mucho acerca de los billones de células en el cuerpo humano. En la búsqueda para comprender mejor las células y el papel que desempeñan en la salud y la enfermedad, una técnica llamada secuenciación de células individuales se ha convertido en un campo de investigación de actualidad.
En los últimos cinco años ha habido una explosión de nuevas herramientas de análisis para interpretar datos unicelulares. Esto ha dejado a los investigadores con cientos de opciones para elegir en la difícil tarea de interpretar conjuntos de datos biológicos grandes y complejos.
El profesor asociado Ritchie dijo que la capacidad de identificar y definir cada célula y su actividad era invaluable para prevenir y tratar enfermedades.
"El desafío es que se genera una cantidad colosal de datos biológicos complejos a partir de estudios unicelulares".
"Nuestra plataforma ofrece una solución a esto al ayudar a los investigadores a comprender de manera precisa y eficiente las cantidades abrumadoras de información de sus estudios", dijo.
El Dr. Kim-Anh Lê Cao dijo que elegir la herramienta de análisis de datos correcta es crucial para evitar resultados engañosos o la interpretación biológica incorrecta de los datos.
"Uno de los mayores desafíos que enfrentamos en esta área de investigación es nuestra capacidad de comparar la eficiencia de todos los métodos de análisis disponibles actualmente. Esto solo se puede hacer si tenemos buenos datos como CellBench para hacer esta evaluación comparativa".
"CellBench ya permite a los investigadores elegir el método de análisis correcto y generar conclusiones significativas y precisas a partir de sus datos", dijo.
El profesor asociado Ritchie dijo que estaba claro que había una demanda real de una herramienta de análisis comparativo de una sola célula porque el estudio del equipo ya se había descargado más de 3.000 veces en un servidor de preimpresión para biología llamado bioRxiv y que sus datos ya habían aparecido enotros cinco estudios de investigación
"Estamos muy contentos de ver la rápida utilización y el uso de los datos de nuestro proyecto CellBench", dijo.
Los investigadores esperan que la plataforma sirva para fomentar pruebas más rigurosas, lo que conducirá a métodos de análisis de datos de mejor calidad que se desarrollarán en el futuro. En última instancia, esperan que la plataforma ayude a los investigadores a hacer nuevos descubrimientos y desarrollar terapias más efectivas para elLos principales desafíos de salud de nuestro tiempo.
La investigación fue apoyada por la Iniciativa Chan Zuckerberg y el Consejo Nacional de Investigación Médica y de Salud del Gobierno de Australia.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Instituto Walter y Eliza Hall . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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