El equipo detrás del Estudio de descifrado de trastornos del desarrollo DDD, una de las iniciativas de secuenciación del genoma de enfermedades raras más grandes del mundo, ha desarrollado un nuevo enfoque computacional para identificar variantes genéticas que causan enfermedades en niños pequeños. Este enfoque solo se haceposible mediante el contraste del ADN de los niños con trastornos graves del desarrollo de causa genética desconocida, con el ADN de personas sin trastornos del desarrollo evidentes. Estos participantes en la investigación fueron extraídos de todo el mundo.
Ya se han identificado más de 1,000 causas genéticas diferentes de trastornos del desarrollo, pero estas solo representan aproximadamente un tercio de todos los niños con tales trastornos.
La mayoría de los trastornos del desarrollo individual son tan raros que confunden los esfuerzos para descubrir sus causas, de ahí la importancia de adoptar un enfoque nacional.
En el estudio, publicado en Genética de la naturaleza , el equipo de DDD analizó muestras de más de 4,000 familias de todo el Reino Unido y la República de Irlanda con al menos un niño afectado por un trastorno del desarrollo y aplicó una estrategia computacional para identificar grupos de niños afectados que tenían características clínicas similares y daños compartidosvariantes genéticas en el mismo gen. La comparación de las variantes observadas en estos genes en los niños afectados con la variación genética observada en más de 60,000 participantes en la investigación, que han acordado compartir sus datos genéticos para apoyar la investigación médica, permitió al equipo identificar cuatro previamentetrastornos genéticos no caracterizados.
El poder del estudio se basa en la contribución de miles de personas que han acordado compartir datos genéticos para apoyar la investigación médica y el trabajo del consorcio de Agregación del Exoma ExAC para reunir esos datos y ponerlos a disposición ampliamente.
"Con la contribución de miles de personas a la investigación médica, tenemos el poder de descubrir mutaciones detrás de algunas condiciones devastadoras", dice el Dr. Matthew Hurles, líder del proyecto en el Wellcome Trust Sanger Institute. "Su altruismo puede revelar los secretos ennuestros genomas, brindando respuestas a familias desesperadas por comprender la condición de sus hijos y permitiendo que esas familias accedan a apoyo y participen en estudios adicionales para investigar posibles estrategias terapéuticas "
El equipo de DDD se centró en los trastornos genéticos en los que un niño hereda una copia dañada de un gen de ambos padres, ninguno de los cuales tiene el trastorno porque también llevan una copia de respaldo del gen sin daños. Definición de las variantes genéticas que causanEstos desórdenes raros se han basado con mayor frecuencia en estudios de extensos árboles genealógicos, donde varias personas se ven afectadas con el mismo desorden, o en estudios de individuos no relacionados que comparten el mismo desorden muy distintivo. Para muchos desórdenes del desarrollo, estos requisitos no se cumplen.
El equipo analizó los genes que codifican más de 18,000 proteínas en los genomas de las familias, buscando variantes que podrían evitar que cada proteína funcione, y descubrió 74 genes en los que las mutaciones podrían desempeñar un papel. Para cuatro de estos genes, comparaciones con el conjunto de datos ExACreveló que estas variantes dañinas se enriquecieron enormemente en los niños afectados en comparación con las personas sin trastornos del desarrollo.
Las condiciones de los niños fueron evaluadas clínicamente de manera sistemática para caracterizar objetivamente el trastorno. Esta evaluación sistemática fue esencial para el análisis computacional a gran escala para descubrir trastornos raros, especialmente para encontrar aquellos con presentaciones clínicas menos consistentes o inespecíficas. Aunque el diagnóstico genético noInicialmente no ofrece nuevos tratamientos, ayuda a las familias a comprender el trastorno de sus hijos, puede ayudarlos a acceder a otro tipo de apoyo y les permite participar en estudios adicionales para investigar posibles terapias.
Las variantes dañinas en niños con trastornos del desarrollo afectaron los genes involucrados en el desarrollo del cerebro, la configuración del corazón y otros órganos en el desarrollo embrionario temprano y el crecimiento óseo. Para cada uno de los cuatro nuevos trastornos, se obtuvo apoyo adicional al observar que los ratones que teníanLa mutación en el gen equivalente compartía muchas características que se parecían a la condición humana.
"Se necesitan desesperadamente nuevas estrategias para descubrir las causas genéticas de enfermedades raras", dice el Dr. Daniel MacArthur, Profesor Asistente de la Facultad de Medicina de Harvard y coordinador del proyecto ExAC, que no participó en el estudio ". Este estudio muestra quevalor de métodos de análisis inteligentes, junto con datos genéticos de poblaciones de todo el mundo del proyecto ExAC, para encontrar respuestas para familias de enfermedades raras ".
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Materiales proporcionado por Instituto Wellcome Trust Sanger . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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