Una estrategia de publicación mejorada para los autores que usan software de modelado hidrológico facilitará la comprensión y reutilización de los datos del modelo para los lectores, según un equipo internacional de investigadores.
Un número creciente de modelos computacionales, como el Modelo Hidrológico Integrado de Penn State PIHM, muestra el flujo de agua de superficie y subsuperficial acoplado y su papel en la diversidad de procesos del sistema de la Tierra. Estos modelos conceptualizan representaciones de los procesos físicos que rigen el movimientode agua sobre, encima y debajo de la superficie de la Tierra.
El problema con estos modelos es que son técnicamente complejos e involucran muchos procesos acoplados complicados y, por lo tanto, no son fácilmente comprensibles para un grupo potencialmente mayor de usuarios en los campos de las geociencias y la ingeniería.
Para solucionar esto, los investigadores de Penn State, la Universidad de Delaware y el Instituto Nacional de Investigación Científica en Quebec desarrollaron una estrategia de publicación que permite a los autores documentar completamente el flujo de trabajo de datos para que las simulaciones puedan reproducirse fácilmente. Esto permite una audiencia más ampliala capacidad de acceder a los datos y obtener una mejor comprensión de la investigación. Los investigadores publicaron sus resultados en Ciencias de la Tierra y el espacio .
"Claramente, hay una gran cantidad de literatura sobre software reutilizable", dijo Xuan Yu, reciente investigador postdoctoral e investigador postdoctoral de Penn State en el Departamento de Ciencias Geológicas de la Universidad de Delaware ". El valor de nuestro trabajo radica enlos pasos prácticos y las mejores prácticas para preservar y reutilizar datos como una rutina potencial en futuras publicaciones de geociencia ".
El PIHM es un modelo hidrológico basado en la física que simula un ciclo natural del agua. Fue desarrollado originalmente para apoyar el concepto de "modelos comunitarios" para las predicciones ambientales. Sin embargo, los investigadores se dieron cuenta rápidamente de que había varios problemas comunes con el aprendizaje PIHMproceso. En muchos de los conjuntos de datos que se introdujeron en PIHM, los autores omitieron los detalles críticos de la publicación. Sin estos detalles, la adaptación no podría reutilizarse en estudios posteriores. La preparación de datos también significó que los usuarios tenían que aprender el código fuente debido a la complejidad del proceso.conjuntos de datos y parámetros. Si hubo un pequeño error, arrojó todo el sistema.
Para resolver este problema, el equipo desarrolló mejores técnicas para la publicación relacionada con PIHM para que incluso los lectores novatos puedan reproducir los resultados de la simulación de PIHM desde cero.
Los investigadores guiaron a los nuevos usuarios a través del procesamiento de datos y la aplicación de modelos utilizando conjuntos de datos accesibles permanentemente y conjuntos de datos vinculados, software y figuras. Esta estrategia de publicación permitió una comprensión más intuitiva de los procesos de flujo de superficie-subsuperficie acoplados y cómo se traducen en estrategias de salida reproduciblespara una amplia gama de consumidores. Proporcionar conjuntos de datos completos y fuentes también ayudó a los usuarios a probar la capacidad de reproducir cada paso del cálculo y mejorar el modelo, desarrollando nuevos métodos a medida que avanzaban. Los usuarios acordaron que la reproducibilidad del modelo condujo a una comprensión más profundade la física del modelo y los datos de apoyo.
El equipo espera que al adoptar estas prácticas al informar a los lectores, puedan aumentar la confiabilidad de los resultados de la simulación, reducir la curva de aprendizaje y mejorar la utilidad del modelo.
La estrategia de publicación también podría adaptarse para futuras investigaciones de geociencia e integrarse con la participación de la comunidad para atraer a un público más amplio de geocientíficos e ingenieros.
"Tenemos la intención de continuar lo que hemos comenzado a través de talleres y conferencias", dijo Yu. "Las mejores prácticas para la publicación requieren el esfuerzo de los investigadores y el apoyo de agencias y sociedades profesionales para tener éxito. Por lo tanto, hemos estado dando conferencias en muchas universidadese institutos de investigación para inspirar una amplia discusión y participación de las prácticas científicas abiertas ".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Estado Penn . Original escrito por Jennifer Matthews. Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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