Investigadores de la Universidad Estatal de Carolina del Norte han creado un nuevo servicio en línea, ChemMaps, que permite a los usuarios navegar de forma interactiva por el espacio químico de más de 8,000 medicamentos y 47,000 compuestos ambientales en 3D y en tiempo real. ChemMaps está diseñado para ser un recurso centralpara estudiantes e investigadores que quieran visualizar y estudiar fácilmente conjuntos complicados de estructuras químicas.
"La premisa de ChemMaps era convertirlo en el Google Maps de medicamentos", dice Denis Fourches, profesor asistente de química en NC State. "Permite a cualquier persona que use una computadora o tableta navegar y navegar fácilmente por el espacio químico de los productos comercializadosmedicamentos en un entorno 3D. Realmente queríamos que la interfaz gráfica de ChemMaps fuera relevante para un estudiante o un especialista en química médica ".
Con ChemMaps, los productos químicos se ven como estrellas, puntos de luz dispersos por la pantalla. Cada estrella o compuesto se coloca en relación con los demás dentro del complejo espacio químico en función de sus propiedades estructurales. Cuando un usuario hace clic en unestrella de compuesto particular, se muestran varias características clave de ese químico: su nombre sistemático, nombre de marca, estructura química, indicación médica, identificadores externos y otras propiedades físico-químicas.
Actualmente, hay dos mapas principales disponibles. DrugMap incluye alrededor de 8.000 medicamentos comercializados, en desarrollo y retirados y se preparó a partir de la base de datos de DrugBank. El mapa medioambiental, o EnvMap, incluye más de 47.000 compuestos como pesticidas oretardantes de relevancia para el Instituto Nacional de Estudios de Salud Ambiental NIEHS y la Agencia de Protección Ambiental de los Estados Unidos EPA y se preparó a partir de Tox21, Toxcast y otras bases de datos del NIEHS.
Los investigadores planean agregar funciones a lo largo del tiempo, incluida la capacidad de los colaboradores y las empresas de visualizar y proyectar conjuntos de productos químicos patentados en los ChemMaps. También planean hacer que los mapas sean aún más interactivos, fáciles de manipular y compatibles con sistemas aumentados ydispositivos de realidad virtual.
"Esta es la primera herramienta en el dominio público que permite a cualquier persona, particularmente a los no expertos en química informática, acceder de manera fácil, visual y rápida a toda esta información química compleja en un solo lugar", dice Fourches. "Esta herramienta podría ayudar mejor a los investigadorescomprender la vecindad química de un compuesto en particular. De hecho, esto es fundamental para la reutilización de medicamentos o la evaluación de riesgos químicos ".
La investigación aparece en Bioinformática . El Dr. Alex Borrel, ex becario postdoctoral de NC State actualmente en el NIEHS y primer autor del artículo, creó el programa. Fourches concibió ChemMaps y es el autor correspondiente. La Dra. Nicole Kleinstreuer, bióloga computacional del NIEHS, también contribuyó ala obra.
La primera versión del sitio web de uso gratuito está disponible en http://www.chemmaps.com .
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad Estatal de Carolina del Norte . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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