El potencial terapéutico de las células madre pluripotentes inducidas por humanos iPSC, que son capaces de convertirse en casi cualquier tipo de célula en el cuerpo humano, es bien reconocido y ampliamente perseguido, pero su carga mutacional aún no se ha caracterizado completamente.
Las IPSC se reprograman a partir de tejidos somáticos, incluidas las células de la piel que pueden acumular muchas mutaciones somáticas mutaciones que no se heredan debido a la exposición a la luz solar y la radiación ultravioleta. Si bien los estudios anteriores han caracterizado parcialmente las mutaciones somáticas presentes en las iPSC, una comprensión completa defalta su carga mutacional, a pesar de que se han desarrollado más de 1,000 líneas iPSC en todo el mundo.
En un nuevo estudio, publicado en la edición de esta semana de Informes de celda , investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de California en San Diego analizaron las secuencias genómicas completas de 18 líneas de iPSC derivadas de células de la piel que habían reprogramado para identificar y caracterizar las mutaciones somáticas.
"Las células madre pluripotentes inducidas representan una gran oportunidad para la ciencia y la medicina, pero para usarlas de manera real y efectiva necesitamos comprender más completamente su carga mutacional", dijo el autor principal Kelly A. Frazer, PhD, director de la UC San DiegoInstituto de Medicina Genómica y jefe fundador de la División de Ciencias de la Información del Genoma de la Facultad de Medicina de la Universidad de California en San Diego. "Si podemos detectar mutaciones somáticas para cada línea iPSC de forma individual, podemos usar esa información para priorizar las líneas iPSC para los modelosde enfermedades humanas específicas y / o terapias de trasplante "
En su investigación, Frazer y sus colegas utilizaron datos de secuenciación del genoma completo, transcriptoma y epigenoma para identificar y caracterizar mutaciones en 18 líneas iPSC incluidas en el recurso iPSCORE y disponibles públicamente en WiCell, una organización sin fines de lucro que proporciona líneas de células madre para la investigacióny pruebas
Además de caracterizar más ampliamente dos clases previamente identificadas de mutaciones somáticas en iPSCs - mutaciones clonales derivadas de la célula parental y alteraciones del número de copias duplicaciones o deleciones de porciones más grandes de un cromosoma - los investigadores descubrieron y caracterizaron dosNuevas clases: mutaciones causadas por daño por radiación ultravioleta en la célula parental y mutaciones subclonales que no estaban presentes en la célula parental y ocurrieron durante la reprogramación de iPSC.
Los investigadores encontraron que, si bien la gran mayoría de las mutaciones se encuentran en regiones epigenéticas asociadas con la cromatina cerrada y no alteran la expresión génica, las mutaciones subclonales que ocurrieron durante la reprogramación de iPSC mostraron una mayor asociación con la cromatina activa y la expresión génica alterada.
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Materiales proporcionados por Universidad de California - San Diego . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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