Los científicos españoles han secuenciado el genoma del lince ibérico Lynx pardinus, actualmente uno de los felinos más amenazados del mundo. Han confirmado la "erosión extrema" que sufre su ADN. El lince ibérico tiene uno de los menos genéticamente diversosgenomas. Es incluso menos diverso que otros mamíferos en peligro de extinción, como el guepardo o el demonio de Tasmania, o las aves, como el ibis crestado o el águila pescadora.
El estudio, publicado en la revista científica biología del genoma , ha sido coordinado por científicos de la Estación Biológica de Doñana CSIC. El Centro de Regulación Genómica CRG contribuyó a este proyecto de investigación desde el principio incluyendo varios grupos e instalaciones. En particular, los laboratorios de Roderic Guigó, CedricNotredame y Toni Gabaldón en el Programa de Bioinformática y Genómica, así como en la unidad de Bioinformática CRG. Este es el primer genoma de referencia de mamíferos generado íntegramente en España.
El proyecto, financiado por Banco Santander y gestionado por la Fundación General CSIC, ha integrado los esfuerzos de 50 científicos de grupos de investigación de 12 instituciones, dos de ellos de fuera de España, que cubren una amplia gama de disciplinas, incluidas la bioinformática, la genómica, oncología, evolución y conservación.
Los científicos han logrado leer y organizar 2.400 millones de letras de ADN de Candiles, un lince macho nacido en la población de linces de Sierra Morena, que ahora forma parte de un programa de cría en cautiverio. Para ello, han utilizado una nueva secuenciatécnicas y procedimientos innovadores desarrollados para generar un borrador del genoma de alta calidad con un presupuesto limitado.
Se identificaron un total de 21,257 genes, un número similar al de los seres humanos y otros mamíferos, y se han comparado con los de gatos, tigres, guepardos y perros.
Específicamente, el grupo de Toni Gabaldón en el Centro de Regulación Genómica de Barcelona ha comparado el genoma del lince ibérico con el de otras especies, intentando identificar genes que han perdido su función porque han permanecido aislados y la existencia de una pequeña población de especímenesLos investigadores han encontrado evidencia de modificaciones en los genes relacionados con los sentidos del oído, la vista y el olfato para facilitar la adaptación del lince a su entorno, lo que les ha permitido convertirse en cazadores excepcionales especializados en conejos como presas.
Historia y diversidad del lince ibérico
Con el objetivo de estudiar la historia y la diversidad genética de las especies, se realizó un análisis de los genomas de otros diez linces ibéricos de Doñana y Sierra Morena, las dos únicas poblaciones sobrevivientes en la Península Ibérica, que se han aislado entre sídurante décadas. Los investigadores también han completado un análisis comparativo con un lince europeo, para descubrir los lazos entre los dos linces que habitan Eurasia.
El lince ibérico comenzó a divergir de su especie hermana, el lince euroasiático Lynx lynx hace unos 300,000 años, y las dos especies se separaron por completo hace unos 2,500 años. Durante ese período, continuaron cruzando e intercambiando genes, probablemente en los períodos entre glaciaciones, cuando la climatología permitió que las especies se extendieran y se encontraran en la Península Ibérica y en el sur de Europa.
La historia demográfica del lince ibérico ha estado marcada por tres disminuciones históricas, la última de las cuales tuvo lugar hace unos 300 años, diezmando a su población. Además de esto, hubo una caída drástica en el número de especímenes en el siglo XXsiglo debido a su persecución, la destrucción de su hábitat y dos grandes epidemias virales sufridas por el conejo, su principal fuente de alimento.
Los científicos han interpretado estas caídas demográficas como la causa de los bajos niveles de diversidad observados, y advierten que esto podría afectar la capacidad del lince para adaptarse a los cambios en su entorno clima, enfermedad, etc.. Además, la existencia de múltiples potencialesse han confirmado variantes genéticas dañinas, que podrían estar contribuyendo a la reducción de las tasas de supervivencia y reproducción de la especie.
Este deterioro genético está especialmente marcado en la población de Doñana, más pequeña y aislada durante un período más largo, que tiene la mitad de la diversidad genética del grupo Sierra Morena.
Sin embargo, el estudio refleja la situación antes de que comenzara el intercambio entre las dos poblaciones relictas y su cruzamiento en cautiverio. Estas medidas, tomadas dentro del programa de conservación del lince ibérico, han llevado a mejorar la situación genética de la especie en los últimos añosaños.
El uso de nuevos recursos genómicos, en el marco del proyecto, contribuirá a optimizar la gestión dirigida a preservar la mayor diversidad genética, además de disminuir los defectos genéticos de estas poblaciones tanto como sea posible.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Centro de Regulación Genómica . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
Referencia del diario :
Cite esta página :