Los científicos de la Universidad de Liverpool han dado un paso más en la comprensión de las bacterias que están causando una devastadora Salmonella epidemia que actualmente mata a unas 400,000 personas cada año en África subsahariana.
Publicado en la revista PLOS Biología y representando cinco años de trabajo, los investigadores del Instituto de Biología Integrativa han completado uno de los estudios comparativos de expresión génica comparativos más grandes hasta la fecha.
La salmonelosis no tifoidea invasiva iNTS ocurre cuando Salmonella las bacterias, que normalmente causan enfermedades gastrointestinales, ingresan al torrente sanguíneo y se propagan a través del cuerpo humano. La epidemia africana iNTS es causada por una variante de Salmonella typhimurium ST313 que es resistente a los antibióticos y generalmente afecta a las personas con sistemas inmunes debilitados por la malaria o el VIH.
"Aunque los genomas de África y global S. Typhimurium son 95% idénticos, el 5% restante es muy diferente ", explica la autora del estudio Dra. Rocío Canals Alvarez." La mayoría de estas diferencias no causan cambios en la expresión génica, pero necesitamos identificar las alteraciones genéticas que afectan la expresión génica ypodría influir en el resultado de una infección bacteriana en humanos "
Para descubrir estas diferencias genéticas clave, los investigadores llevaron a cabo un enfoque transcriptómico comparativo a gran escala entre los africanos letales Salmonella y la versión común 'global' que causa gastroenteritis.
Los investigadores crecieron cada uno de los Salmonella cepas de 16 formas diferentes que representan diferentes etapas del proceso de infección humana. También aislaron Salmonella de macrófagos de ratón, células inmunes utilizadas por las bacterias para secuestrar al huésped durante la infección.
Al investigar el transcriptoma de África y global S. Typhimurium en estas condiciones diferentes, descubrieron que 677 genes y ARN pequeños se expresaron de manera diferente entre las dos cepas.
Un enfoque proteómico paralelo identificó las diferencias de expresión génica que condujeron a alteraciones a nivel de proteína. Dos experimentos de prueba de principio revelaron la base genética de un defecto metabólico de Salmonella africana y descubrieron un nuevo sistema de mantenimiento de plásmidos bacterianos.
Para permitir que los investigadores de todo el mundo trabajen con la nueva información, los nuevos datos se presentan en una herramienta en línea fácil de usar llamada el compendio de expresión génica SalComD23580.
"Este estudio lleva el poder de la transcriptómica a un nuevo nivel para una bacteria. Nuestro enfoque de 'transcriptómica funcional' es relevante para una audiencia amplia y puede aplicarse a muchos otros organismos. La tubería analítica y los aspectos de recursos de datos comunitarios son genéricosy podría inspirar a otros a usar un enfoque similar para responder sus preguntas de investigación ", agrega el profesor Jay Hinton, quien dirigió el estudio.
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Materiales proporcionados por Universidad de Liverpool . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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