Los animales raros y extintos se conservan en frascos de alcohol en las colecciones de museos de historia natural de todo el mundo, que proporcionan una gran cantidad de información sobre la biodiversidad cambiante del planeta. Estos especímenes preservados de serpientes, lagartos, ranas, peces y otros animales puedenduran hasta 500 años cuando se procesan en una sustancia química llamada formalina. Si bien la formalina ayuda a preservar la muestra haciéndola rígida y duradera, plantea un desafío para extraer y secuenciar ADN. Además, el ADN se degrada y se divide en pequeños fragmentos con el tiempo. Este ADN fragmentadoes difícil de amplificar en largos tramos informativos de ADN que se pueden utilizar para examinar las relaciones evolutivas entre especies cuando se utiliza la tecnología de secuenciación de ADN más antigua. Por lo tanto, los científicos no han podido secuenciar efectivamente el ADN de estas muestras hasta ahora.
El conservador del Museo de Ciencias Naturales de LSU y el profesor Christopher Austin y su colaborador Rutgers-Newark, la profesora asistente Sara Ruane desarrollaron un protocolo y probaron un método para secuenciar el ADN de miles de genes de estos especímenes de serpiente intratables. Su investigación fue publicada hoy en la revista científica internacionaldiario Recursos de ecología molecular .
"Los museos de historia natural son depósitos de especies extintas. Desafortunadamente, los naturalistas en el siglo XIX no estaban recolectando muestras para análisis que realizamos hoy en día, como la secuenciación de ADN. Ahora con estos nuevos métodos, podemos obtener el ADN de estas muestras y secuencias muy antiguasespecies extintas como el pájaro carpintero de marfil, el lobo de Tasmania y el pájaro dodo ", dijo Austin.
Él y Ruane encontraron y probaron un enfoque que incluye tomar un pequeño pedazo de tejido hepático de la muestra de serpiente, calentarlo durante un período de tiempo más largo y aplicar una enzima que digiere la muestra de tejido y permite extraer el ADN.Su protocolo mínimamente invasivo conserva la muestra para que se pueda recopilar información adicional de la muestra en el futuro. También incluye la aplicación de la última tecnología para secuenciar químicamente el ADN de las muestras.
"Un genoma es un rompecabezas complejo dividido en cientos de millones de piezas pequeñas. Podemos secuenciar esas piezas y volver a armarlas computacionalmente", dijo Austin.
Extrajeron y secuenciaron el ADN de 13 especímenes de serpiente históricos o raros de todo el mundo, muchos de los cuales nunca habían sido analizados utilizando métodos genéticos modernos. Algunos de los especímenes tenían más de 100 años. También integraron estos datos con datos modernosmuestras para crear un árbol genealógico genético, o filogenia, que mapee las relaciones evolutivas de varias especies de serpientes. Este trabajo dio como resultado miles de marcadores genéticos para especímenes de serpientes recolectados desde principios del siglo XX.
"Lo interesante de este trabajo es que hace que las especies que se han perdido esencialmente para la ciencia, debido a la extirpación, la rareza o el secreto general, que se aplica a muchos animales y no solo a las serpientes, estén disponibles para la investigación científica en la era moderna degenómica ", dijo Ruane.
"También creemos que esta investigación beneficiará a los científicos que trabajan con animales raros que son difíciles de recolectar o están extintos pero que están representados en colecciones históricas preservadas con fluidos. También subraya la importancia continua de las colecciones de museos en la ciencia moderna", dijo Austin.
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Materiales proporcionado por Universidad Estatal de Louisiana . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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