CIRAD y sus socios tuvieron que usar la astucia para establecer la primera secuencia de referencia de la caña de azúcar. El genoma de la planta es tan complejo que las técnicas de secuenciación convencionales habían resultado inútiles. Esto significaba que la caña de azúcar fue la última planta cultivada importante en secuenciar su genoma.
Un nuevo método de secuenciación
El equipo tomó el guante usando un enfoque ingenioso basado en un descubrimiento realizado en CIRAD hace unos 20 años: las estructuras genómicas de la caña de azúcar y el sorgo son muy similares. El término utilizado para esto es "colinearidad", lo que significa que existecierto grado de paralelismo, con numerosos genes en el mismo orden. Olivier Garsmeur, investigador de CIRAD y autor principal del estudio, pudo utilizar el genoma del sorgo como plantilla para ensamblar y seleccionar los fragmentos de cromosomas de la caña de azúcar para secuenciar ".Gracias a este novedoso método, la secuencia de referencia obtenida para un cultivar de Réunion, R570, es de muy buena calidad ", dice Angélique D'Hont, una genetista de CIRAD que coordinó el estudio.
Una etapa clave en la investigación del genoma
Esa secuencia de referencia es un paso vital hacia la secuenciación completa del genoma de la caña de azúcar y el análisis de las variaciones entre las diversas variedades de caña de azúcar de manera más efectiva. Angélique D'Hont tuvo la misma experiencia con el genoma del plátano en 2012. Como dice, "tener una referenciala secuencia de una especie cambia radicalmente todos los enfoques genómicos y genéticos de esa especie ".
Una nueva era para la cría de caña de azúcar
Al igual que con todas las demás plantas cultivadas anteriores, el mejoramiento de la caña de azúcar ahora podrá entrar en la era de la biología molecular. Hasta ahora, por falta de una secuencia de referencia, los programas de mejoramiento de cultivos de caña de azúcar estaban restringidos a la hibridación, seguidos de los convencionales, muy engorrososevaluaciones de campo. Ahora se pueden desarrollar técnicas de cribado molecular para complementar las pruebas de campo. Este es un gran avance, ya que casi el 80% del azúcar del mundo proviene de la caña de azúcar. Además, la planta también se ha convertido recientemente en líder en la carrera para producir biomasa.Este nuevo conocimiento genético servirá para crear nuevas variedades para una gama más amplia de usos.
caña de azúcar, un genoma complejo
El genoma de la caña de azúcar es complejo por varias razones :
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Materiales proporcionado por Cirad . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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