Hoy anunciaron los investigadores de UC Davis en Comunicaciones de la naturaleza que han desbloqueado un tesoro de información genética sobre la lechuga y plantas relacionadas, liberando el primer ensamblaje completo del genoma de la lechuga y la enorme familia de plantas Compositae.
lechuga de jardín, o Lactuca sativa , es la especie de planta que incluye el valor de una barra de ensaladas en tipos de lechuga, desde iceberg hasta lechuga romana. Con un valor anual en la granja de más de $ 2.4 mil millones, es la verdura fresca más valiosa y una de las 10 más valiosascultivos, en general, en los Estados Unidos.
La lechuga es un miembro de la enorme familia de las Compositae, que incluye lo bueno, lo malo y lo feo del mundo vegetal, desde la margarita y el girasol hasta la ambrosía y el temido cardo estrella.
El ensamblaje del genoma, una compilación de millones de secuencias de ADN en un retrato genético útil, proporciona a los investigadores una herramienta valiosa para explorar las muchas especies de plantas relacionadas de la familia Compositae.
"Este ensamblaje del genoma proporciona la base para numerosos estudios genéticos, evolutivos y funcionales adicionales de toda esta familia de plantas", dijo Sebastian Reyes-Chin-Wo, autor principal y estudiante de posgrado en el laboratorio del genetista de plantas Richard Michelmore.
"Esto es particularmente significativo porque Compositae es la familia de plantas con flores más exitosa en la tierra en términos de la cantidad de especies y ambientes habitados", dijo Richard Michelmore, quien dirige el UC Davis Genome Center.
Los genes triplicados pueden explicar el éxito :
Los investigadores encontraron que genes específicos en el genoma de la lechuga eran consistentes con ciertos rasgos físicos, como la producción de una savia lechosa que contiene caucho, que también se han encontrado en especies taxonómicamente distintas, como el árbol del caucho.
El estudio también proporcionó evidencia de que en algún momento durante la evolución de la lechuga hace unos 45 millones de años, su genoma se "triplicó". Como resultado, una cuarta parte del genoma, incluido aproximadamente el 30 por ciento de todos sus genes identificados,- ahora aparece en múltiples regiones relacionadas. Debido a que tales duplicaciones genómicas pueden dar a las especies de plantas una ventaja en la colonización de nuevos ambientes, el evento de triplicación antigua podría, en parte, explicar el éxito de la familia de plantas Compositae.
La nueva tecnología produce información más precisa :
Michelmore señaló que este es el primer ensamblaje del genoma reportado de una especie vegetal resultante del uso de una nueva tecnología que brinda información sobre la proximidad física de las secuencias de ADN a las que se unen las proteínas.
El nuevo enfoque, desarrollado por Dovetail Genomics, una compañía derivada de UC Santa Cruz, resultó en un ensamblaje del genoma más contiguo y preciso, aunque la lechuga tiene uno de los genomas de plantas más grandes secuenciados hasta la fecha, dijo.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de California - Davis . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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