Las capas germinales en la organogénesis difieren en tres procesos: pliegues, divisiones y condensación.

El desarrollo temprano durante esta etapa en los animales cordados es el tubo neural y la notocorda.

Todos los animales vertebrados difieren de la gastrula de la misma manera.

Los vertebrados desarrollan una cresta neural que se diferencia en muchas estructuras, incluidos algunos huesos, músculos y componentes del sistema nervioso periférico.

El celoma del cuerpo se forma a partir de una división del mesodermo a lo largo del eje somita.